Анализ на динамиката на микробното разнообразие във времето — Анализ на лонгитюдния микробен разнообразен състав
Анализът на микробното разнообразие във времето проследява как богатството, равномерността и съставът на микробните общности се променят през множество времеви точки в рамките на едни и същи индивиди. Чрез комбиниране на стандартни метрики за разнообразие с лонгитюдни статистически модели, той отделя истинската времева динамика от междуиндивидуалната вариация, идентифицирайки кога и как смущения като промени в диетата, антибиотично лечение или начало на заболяване преоформят микробиома.
Прочетете целия метод
Влезте с безплатен профил, за да прочетете този раздел.
Карта на методите
Обкръжението на сродните методи — изберете възел, за да го разгледате.
Източници
- Callahan, B. J., McMurdie, P. J., Rosen, M. J., Han, A. W., Johnson, A. J. A., & Holmes, S. P. (2016). DADA2: High-resolution sample inference from Illumina amplicon data. Nature Methods, 13(7), 581–583. DOI: 10.1038/nmeth.3869 ↗
- Chen, Y., Lun, A. T. L., & Smyth, G. K. (2023). Differential abundance testing on single-cell data using quasi-likelihood methods. Genome Biology, 24(1), 188. link ↗
Как да цитирате тази страница
ScholarGate. (2026, June 3). Longitudinal Microbiome Diversity Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/bg/bioinformatics/time-series-microbiome-diversity-analysis
Кой метод?
Поставете този метод до най-близките му сродни методи и ги четете едно до друго — библиотеката полага книгите на масата; изборът е ваш.
- Мулти-омичен анализ на разнообразието на микробиомаБиоинформатика↔ сравняване
- Анализ на обогатяване на пътищаБиоинформатика↔ сравняване
- RNA-seq анализ на диференциална експресияБиоинформатика↔ сравняване
- Анализ на едноклетъчна РНК секвенция (scRNA-seq)Биоинформатика↔ сравняване
- Диференциален анализ на експресията при времеви редове от RNA-seqБиоинформатика↔ сравняване
Similar methods
Забелязахте ли проблем на тази страница? Съобщете или предложете поправка →