Анализ на обогатяване на генни набори във времеви редове — Динамично обогатяване на пътища във времеви точки
Анализът на обогатяване на генни набори във времеви редове (TS-GSEA) разширява класическата рамка на GSEA, за да открие биологично координирани генни набори — пътища, термини от генна онтология или курирани сигнатури — чиито колективни експресионни промени са смислени във времето. Вместо да сравнява две моментни снимки, той моделира цялата времева траектория на генната експресия, за да идентифицира кои функционални програми се активират, потискат или динамично се преструктурират по време на биологичен процес като развитие, отговор на лечение или прогресия на заболяване.
Прочетете целия метод
Влезте с безплатен профил, за да прочетете този раздел.
Карта на методите
Обкръжението на сродните методи — изберете възел, за да го разгледате.
Източници
- Subramanian, A., Tamayo, P., Mootha, V. K., Mukherjee, S., Ebert, B. L., Gillette, M. A., Paulovich, A., Pomeroy, S. L., Golub, T. R., Lander, E. S., & Mesirov, J. P. (2005). Gene set enrichment analysis: A knowledge-based approach for interpreting genome-wide expression profiles. Proceedings of the National Academy of Sciences, 102(43), 15545–15550. DOI: 10.1073/pnas.0506580102 ↗
- Nueda, M. J., Tarazona, S., & Conesa, A. (2014). Next maSigPro: updating maSigPro bioconductor package for RNA-seq time series. Bioinformatics, 30(18), 2598–2602. DOI: 10.1093/bioinformatics/btu333 ↗
Как да цитирате тази страница
ScholarGate. (2026, June 3). Time-Series Gene Set Enrichment Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/bg/bioinformatics/time-series-gene-set-enrichment-analysis
Кой метод?
Поставете този метод до най-близките му сродни методи и ги четете едно до друго — библиотеката полага книгите на масата; изборът е ваш.
- Анализ на обогатяване на генни набори (GSEA)Биоинформатика↔ сравняване
- Мултиомиксен анализ на обогатяване на генни набориБиоинформатика↔ сравняване
- Анализ на обогатяване на пътищаБиоинформатика↔ сравняване
- RNA-seq анализ на диференциална експресияБиоинформатика↔ сравняване
- Анализ на едноклетъчна РНК секвенция (scRNA-seq)Биоинформатика↔ сравняване
- Диференциален анализ на експресията при времеви редове от RNA-seqБиоинформатика↔ сравняване
Similar methods
Забелязахте ли проблем на тази страница? Съобщете или предложете поправка →