Анализ на обогатяване на генни набори (GSEA)
Анализът на обогатяване на генни набори (GSEA) е изчислителен метод, който определя дали предварително зададен набор от гени — представляващ биологичен път, процес или функция — показва статистически значими, координирани разлики между две биологични състояния. За разлика от простото филтриране по коефициент на изменение (fold-change), GSEA работи върху всички измерени гени, класирани по метрика за корелация, откривайки фини, но последователни промени в целия път, дори когато нито един отделен ген не преминава праг за значимост.
Прочетете целия метод
Влезте с безплатен профил, за да прочетете този раздел.
Карта на методите
Обкръжението на сродните методи — изберете възел, за да го разгледате.
+27 още
Източници
- Subramanian, A., Tamayo, P., Mootha, V. K., Mukherjee, S., Ebert, B. L., Gillette, M. A., Paulovich, A., Pomeroy, S. L., Golub, T. R., Lander, E. S., & Mesirov, J. P. (2005). Gene set enrichment analysis: A knowledge-based approach for interpreting genome-wide expression profiles. Proceedings of the National Academy of Sciences, 102(43), 15545–15550. DOI: 10.1073/pnas.0506580102 ↗
- Mootha, V. K., Lindgren, C. M., Eriksson, K. F., Subramanian, A., Sihag, S., Lehar, J., Puigserver, P., Carlsson, E., Ridderstrale, M., Laurila, E., Houstis, N., Daly, M. J., Patterson, N., Mesirov, J. P., Golub, T. R., Tamayo, P., Spiegelman, B., Lander, E. S., Hirschhorn, J. N., Altshuler, D., & Groop, L. C. (2003). PGC-1alpha-responsive genes involved in oxidative phosphorylation are coordinately downregulated in human diabetes. Nature Genetics, 34(3), 267–273. DOI: 10.1038/ng1180 ↗
Как да цитирате тази страница
ScholarGate. (2026, June 3). Gene Set Enrichment Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/bg/bioinformatics/gene-set-enrichment-analysis
Кой метод?
Поставете този метод до най-близките му сродни методи и ги четете едно до друго — библиотеката полага книгите на масата; изборът е ваш.
- Мултиомиксен анализ на обогатяване на генни набориБиоинформатика↔ сравняване
- Мрежово-базиран анализ за обогатяване на генни множестваБиоинформатика↔ сравняване
- Анализ на обогатяване на пътищаБиоинформатика↔ сравняване
- RNA-seq анализ на диференциална експресияБиоинформатика↔ сравняване
- Анализ на едноклетъчна РНК секвенция (scRNA-seq)Биоинформатика↔ сравняване
Цитиран в
Similar methods
Забелязахте ли проблем на тази страница? Съобщете или предложете поправка →