Анализ на едноклетъчна РНК-секвенция във времеви редове — Темпорална транскриптомика с едноклетъчна резолюция
Анализът на едноклетъчна РНК-секвенция във времеви редове улавя генната експресия в множество времеви точки с едноклетъчна резолюция, за да разкрие как клетъчните популации възникват, преминават и се разклоняват по време на динамични биологични процеси като развитие, диференциация или прогресия на заболяване. Чрез комбиниране на подредба по псевдовреме, РНК скорост и тестване на диференциална динамика, изследователите реконструират темпоралната траектория на отделните клетки и идентифицират генните регулаторни промени, които движат биологичните преходи.
Прочетете целия метод
Влезте с безплатен профил, за да прочетете този раздел.
Карта на методите
Обкръжението на сродните методи — изберете възел, за да го разгледате.
Източници
- Trapnell, C., Cacchiarelli, D., Grimsby, J., Pokharel, P., Li, S., Morse, M., Lennon, N. J., Livak, K. J., Mikkelsen, T. S., & Rinn, J. L. (2014). The dynamics and regulators of cell fate decisions are revealed by pseudotemporal ordering of single cells. Nature Biotechnology, 32(4), 381-386. DOI: 10.1038/nbt.2859 ↗
- La Manno, G., Soldatov, R., Zeisel, A., Braun, E., Hochgerner, H., Petukhov, V., Lidschreiber, K., Kastriti, M. E., Lonnerberg, P., Furlan, A., Fan, J., Borm, L. E., Liu, Z., van Bruggen, D., Guo, J., He, X., Linnarsson, S., & Kharchenko, P. V. (2018). RNA velocity of single cells. Nature, 560(7719), 494-498. DOI: 10.1038/s41586-018-0414-6 ↗
Как да цитирате тази страница
ScholarGate. (2026, June 3). Time-Series Single-Cell RNA Sequencing Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/bg/bioinformatics/time-series-single-cell-rna-seq-analysis
Кой метод?
Поставете този метод до най-близките му сродни методи и ги четете едно до друго — библиотеката полага книгите на масата; изборът е ваш.
- Анализ на вариациите в броя на копиятаБиоинформатика↔ сравняване
- eQTL анализБиоинформатика↔ сравняване
- Анализ на обогатяване на генни набори (GSEA)Биоинформатика↔ сравняване
- Анализ на обогатяване на пътищаБиоинформатика↔ сравняване
- RNA-seq анализ на диференциална експресияБиоинформатика↔ сравняване
- Анализ на едноклетъчна РНК секвенция (scRNA-seq)Биоинформатика↔ сравняване
Цитиран в
Similar methods
Забелязахте ли проблем на тази страница? Съобщете или предложете поправка →