ScholarGate
Асистент
Process / pipelineBioinformatics / omics

Извикване на варианти във времеви серии — Лонгитудинално откриване на соматични мутации

Извикването на варианти във времеви серии е биоинформатичен конвейер, който идентифицира и проследява геномни варианти — обикновено соматични мутации — в множество секвенирани проби, събрани от един и същ субект в различни времеви точки. Най-широко се прилага в онкогеномиката за реконструкция на еволюцията на тумора, мониторинг на минималната остатъчна болест и откриване на появата на клонове, резистентни на терапия. Чрез съвместно моделиране на честотите на алелите на вариантите в темпоралното измерение, методът разграничава истинските соматични промени от секвениращия шум и оценява клоналната динамика във времето.

Отворете в MethodMindСкороВидеоСкороИзтегляне на слайдове

Прочетете целия метод

Само за членове

Влезте с безплатен профил, за да прочетете този раздел.

Вход

Карта на методите

Обкръжението на сродните методи — изберете възел, за да го разгледате.

Извикване на варианти във времеви серии
RNA-seq анализ на дифере…

Източници

  1. Nik-Zainal, S., et al. (2012). The life history of 21 breast cancers. Cell, 149(5), 994–1007. link
  2. McMahon, M., et al. (2021). Benchmarking algorithms for clonal evolution analysis using multi-region and longitudinal tumour sequencing data. Briefings in Bioinformatics, 22(3), bbaa163. link

Как да цитирате тази страница

ScholarGate. (2026, June 3). Time-series Variant Calling. ScholarGate. https://scholargate.app/bg/bioinformatics/time-series-variant-calling

Кой метод?

Поставете този метод до най-близките му сродни методи и ги четете едно до друго — библиотеката полага книгите на масата; изборът е ваш.

Сравняване едно до друго
ScholarGateTime-series variant calling (Time-series Variant Calling). Извлечено на 2026-06-15 от https://scholargate.app/bg/bioinformatics/time-series-variant-calling · Набор от данни: https://doi.org/10.5281/zenodo.20539026