Байесовско определяне на варианти — вероятностно откриване на SNP и индели
Байесовското определяне на варианти е изчислителен конвейер, който използва вероятностно извеждане за идентифициране на еднонуклеотидни полиморфизми (SNP), инсерции и делеции в геном, като третира данните от секвениране като доказателство и изчислява апостериорни вероятности за кандидат-генотипи. За разлика от детерминистичните определящи инструменти, базирани на прагови стойности, байесовските подходи изрично моделират грешките при секвениране, несигурността при картирането и честотите на предварителни генотипи, за да произведат калибрирани вероятности за генотипи, които могат да бъдат използвани за последващо филтриране и асоциативно тестване.
Прочетете целия метод
Влезте с безплатен профил, за да прочетете този раздел.
Method map
The neighbourhood of related methods — select a node to explore.
Източници
- McKenna, A., Hanna, M., Banks, E., Sivachenko, A., Cibulskis, K., Kernytsky, A., ... & DePristo, M. A. (2010). The Genome Analysis Toolkit: A MapReduce framework for analyzing next-generation DNA sequencing data. Genome Research, 20(9), 1297–1303. DOI: 10.1101/gr.107524.110 ↗
- Rimmer, A., Phan, H., Mathieson, I., Iqbal, Z., Twigg, S. R., WGS500 Consortium, ... & McVean, G. (2014). Integrating mapping-, assembly- and haplotype-based approaches for calling variants in clinical sequencing applications. Nature Genetics, 46(8), 912–918. DOI: 10.1038/ng.3036 ↗
Как да цитирате тази страница
ScholarGate. (2026, June 3). Bayesian Statistical Variant Calling from Sequencing Data. ScholarGate. https://scholargate.app/bg/bioinformatics/bayesian-variant-calling
Which method?
Set this method beside its closest kin and read them side by side — the library lays the books on the table; the choice is yours.
- Байесов ГВАСБиоинформатика↔ compare
- Анализ на вариациите в броя на копиятаБиоинформатика↔ compare
- RNA-seq анализ на диференциална експресияБиоинформатика↔ compare
- Подравняване на последователностиБиоинформатика↔ compare
- Извикване на варианти от единични клеткиБиоинформатика↔ compare
- Вариантно призоваванеБиоинформатика↔ compare
Цитиран в
Забелязахте ли проблем на тази страница? Съобщете или предложете поправка →