Single-cell GWAS — Анализ на генетична асоциация, специфичен за клетъчния тип
Single-cell GWAS е интегриран биоинформатичен конвейер, който картографира сигнали от проучване на асоциации в целия геном (GWAS) върху ландшафти на транскриптомни данни от единични клетки, за да идентифицира кои клетъчни типове и индивидуални клетки носят непропорционален генетичен риск за заболяване или характеристика. Като използва атласи на РНК секвениране от единични клетки (scRNA-seq) заедно с обобщени статистически данни от GWAS, той надхвърля асоциациите на ниво тъкан, за да разкрие прецизните клетъчни контексти, в които генетичните варианти, свързани със заболявания, упражняват своите ефекти.
Прочетете целия метод
Влезте с безплатен профил, за да прочетете този раздел.
Карта на методите
Обкръжението на сродните методи — изберете възел, за да го разгледате.
Източници
- Zhang, M. J., Hou, K., Dey, K. K., Sakaue, S., Jagadeesh, K. A., Weinand, K., ... & Price, A. L. (2022). Polygenic enrichment distinguishes disease associations of individual cells in single-cell RNA-seq data. Nature Genetics, 54(8), 1224-1234. link ↗
- Bryois, J., Calini, D., Macnair, W., Foo, L., Urich, E., Ortmann, W., ... & De Jager, P. L. (2022). Cell-type-specific cis-eQTLs in eight human brain cell types identify novel risk genes for psychiatric and neurological disorders. Nature Neuroscience, 25(8), 1104-1112. link ↗
Как да цитирате тази страница
ScholarGate. (2026, June 3). Single-Cell Genome-Wide Association Study. ScholarGate. https://scholargate.app/bg/bioinformatics/single-cell-gwas
Кой метод?
Поставете този метод до най-близките му сродни методи и ги четете едно до друго — библиотеката полага книгите на масата; изборът е ваш.
- eQTL анализБиоинформатика↔ сравняване
- Геномно-широко асоциативно изследване (GWAS)Биоинформатика↔ сравняване
- Анализ на обогатяване на пътищаБиоинформатика↔ сравняване
- RNA-seq анализ на диференциална експресияБиоинформатика↔ сравняване
- Едноклетъчен eQTL анализБиоинформатика↔ сравняване
- Анализ на едноклетъчна РНК секвенция (scRNA-seq)Биоинформатика↔ сравняване
Цитиран в
Забелязахте ли проблем на тази страница? Съобщете или предложете поправка →