Process / pipelineBioinformatics / omics

Мрежов анализ на диференциалната експресия на РНК-секвенция

Мрежовият анализ на диференциалната експресия на РНК-секвенция (RNA-seq) интегрира конвенционалното тестване за диференциална експресия с мрежи за взаимодействие на гени — като графи на взаимодействия между протеини или претеглени мрежи за коекспресия — за да идентифицира не само отделни диференциално експресирани гени, но и кохерентни, биологично смислени генни модули, които се променят заедно между условията. Този подход съществено намалява фалшивите положителни резултати и разкрива сигнали на ниво пътека, невидими за тестване ген по ген.

Отворете в MethodMindСкороВидеоСкороDownload slides

Прочетете целия метод

Само за членове

Влезте с безплатен профил, за да прочетете този раздел.

Вход

Method map

The neighbourhood of related methods — select a node to explore.

Източници

  1. Zhang, B., & Horvath, S. (2005). A general framework for weighted gene co-expression network analysis. Statistical Applications in Genetics and Molecular Biology, 4(1), Article 17. link
  2. Ideker, T., Ozier, O., Schwikowski, B., & Siegel, A. F. (2002). Discovering regulatory and signalling circuits in molecular interaction networks. Bioinformatics, 18(Suppl 1), S233–S240. link

Как да цитирате тази страница

ScholarGate. (2026, June 3). Network-based RNA Sequencing Differential Expression Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/bg/bioinformatics/network-based-rna-seq-differential-expression

Which method?

Set this method beside its closest kin and read them side by side — the library lays the books on the table; the choice is yours.

Compare side by side

Цитиран в

ScholarGateNetwork-based RNA-seq differential expression (Network-based RNA Sequencing Differential Expression Analysis). Извлечено на 2026-06-15 от https://scholargate.app/bg/bioinformatics/network-based-rna-seq-differential-expression · Набор от данни: https://doi.org/10.5281/zenodo.20539026