Анализ на едноклетъчна РНК секвенция (scRNA-seq)
Анализът на едноклетъчна РНК секвенция (scRNA-seq) характеризира генната експресия в резолюцията на отделни клетки, което позволява откриването на клетъчни типове, състояния и преходи, невидими при анализ на обемна транскриптомика. Започвайки от сурови секвенционни прочити, работният процес произвежда матрица от броя на клетките по гени и продължава с контрол на качеството, нормализация, редукция на размерността, ненадзиравано клъстериране, анотация на клетъчните типове и редица последващи анализи като извод на траектории и диференциална експресия между клетъчни популации.
Прочетете целия метод
Влезте с безплатен профил, за да прочетете този раздел.
Method map
The neighbourhood of related methods — select a node to explore.
+19 more
Източници
- Satija, R., Farrell, J. A., Gennert, D., Schier, A. F., & Regev, A. (2015). Spatial reconstruction of single-cell gene expression data. Nature Biotechnology, 33(5), 495–502. DOI: 10.1038/nbt.3192 ↗
- Macosko, E. Z., Basu, A., Satija, R., Nemesh, J., Shekhar, K., Goldman, M., ... & McCarroll, S. A. (2015). Highly parallel genome-wide expression profiling of individual cells using nanoliter droplets. Cell, 161(5), 1202–1214. DOI: 10.1016/j.cell.2015.05.002 ↗
Как да цитирате тази страница
ScholarGate. (2026, June 3). Single-cell RNA Sequencing Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/bg/bioinformatics/single-cell-rna-seq-analysis
Which method?
Set this method beside its closest kin and read them side by side — the library lays the books on the table; the choice is yours.
- Анализ на обогатяване на генни набори (GSEA)Биоинформатика↔ compare
- Анализ на обогатяване на пътищаБиоинформатика↔ compare
- RNA-seq анализ на диференциална експресияБиоинформатика↔ compare
- Едноклетъчен eQTL анализБиоинформатика↔ compare
- Извикване на варианти от единични клеткиБиоинформатика↔ compare
Цитиран в
Забелязахте ли проблем на тази страница? Съобщете или предложете поправка →