Анализ на обогатяване на генни множества в единични клетки — scGSEA
Анализът на обогатяване на генни множества в единични клетки (scGSEA) разширява класическия GSEA за обединени проби до резолюцията на отделни клетки. Вместо да тества дали дадено генно множество е обогатено при сравнение на ниво проба, scGSEA присвоява оценка за обогатяване или активност на всяка клетка, което позволява на изследователите да картографират активността на пътищата в хетерогенни клетъчни популации, клетъчни състояния и траектории на развитие, уловени в данни от едноклетъчно RNA-seq.
Прочетете целия метод
Влезте с безплатен профил, за да прочетете този раздел.
Карта на методите
Обкръжението на сродните методи — изберете възел, за да го разгледате.
Източници
- Aibar, S., Gonzalez-Blas, C. B., Moerman, T., Huynh-Thu, V. A., Imrichova, H., Hulselmans, G., Rambow, F., Marine, J.-C., Geurts, P., Aerts, J., van den Oord, J., Kalender Atak, Z., Wouters, J., & Aerts, S. (2017). SCENIC: Single-cell regulatory network inference and clustering. Nature Methods, 14(11), 1083-1086. link ↗
- DeTomaso, D., Jones, M. G., Subramaniam, M., Ashuach, T., Ye, C. J., & Yosef, N. (2019). Functional interpretation of single cell similarity maps. Nature Communications, 10(1), 4376. link ↗
Как да цитирате тази страница
ScholarGate. (2026, June 3). Single-cell Gene Set Enrichment Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/bg/bioinformatics/single-cell-gene-set-enrichment-analysis
Кой метод?
Поставете този метод до най-близките му сродни методи и ги четете едно до друго — библиотеката полага книгите на масата; изборът е ваш.
- Анализ на обогатяване на генни набори (GSEA)Биоинформатика↔ сравняване
- Анализ на обогатяване на пътищаБиоинформатика↔ сравняване
- RNA-seq анализ на диференциална експресияБиоинформатика↔ сравняване
- Анализ на едноклетъчна РНК секвенция (scRNA-seq)Биоинформатика↔ сравняване
- Анализ на диференциална експресия при едноклетъчна РНК-секвенцияБиоинформатика↔ сравняване
Цитиран в
Similar methods
Забелязахте ли проблем на тази страница? Съобщете или предложете поправка →