Process / pipelineBioinformatics / omics

Pathway-verrijkingsanalyse — Biologische Pathway-verrijkingsanalyse

Pathway-verrijkingsanalyse (PEA) is een statistische benadering die een lijst van genen of eiwitten van belang — doorgaans afgeleid van een differentieel-expressie- of proteomicsexperiment — neemt en identificeert welke vooraf gedefinieerde biologische pathways of functionele genensets vaker dan verwacht door toeval vertegenwoordigd zijn. Door individuele moleculaire veranderingen te koppelen aan samengestelde pathway-kennisbanken zoals KEGG, Gene Ontology of Reactome, vertaalt PEA lange genenlijsten naar interpreteerbare biologische processen, waardoor het een centraal instrument is in de post-analyse van high-throughput omics-experimenten.

Openen in MethodMindBinnenkortVideoBinnenkortDia's downloaden

Lees de volledige methode

Alleen voor leden

Inloggen

Methodenkaart

De omgeving van verwante methoden — selecteer een knooppunt om te verkennen.

Pathway-verrijkingsanalyse

Gen-setverrijkingsanalys…Metabolomicsanalyse Netwerkgebaseerde padver…Proteomicsanalyse RNA-seq Differentiele Ex…Single-cell RNA-seq Anal…Bayesiaanse ChIP-seq Pea…Bayesiaanse eQTL-analyse Bayesian gen-set-enrichm…Bayesiaanse GWAS

+43 meer

Bronnen

Subramanian, A., Tamayo, P., Mootha, V. K., Mukherjee, S., Ebert, B. L., Gillette, M. A., Paulovich, A., Pomeroy, S. L., Golub, T. R., Lander, E. S., & Mesirov, J. P. (2005). Gene set enrichment analysis: A knowledge-based approach for interpreting genome-wide expression profiles. Proceedings of the National Academy of Sciences, 102(43), 15545–15550. DOI: 10.1073/pnas.0506580102 ↗
Alexa, A., Rahnenführer, J., & Lengauer, T. (2006). Improved scoring of functional groups from gene expression data by decorrelating GO graph structure. Bioinformatics, 22(13), 1600–1607. DOI: 10.1093/bioinformatics/btl140 ↗

Deze pagina citeren

ScholarGate. (2026, June 3). Biological Pathway Enrichment Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/nl/bioinformatics/pathway-enrichment-analysis

Welke methode?

Plaats deze methode naast haar naaste verwanten en lees ze naast elkaar — de bibliotheek legt de boeken op tafel; de keuze is aan u.

Gen-setverrijkingsanalyse (GSEA)Bio-informatica↔ vergelijken
MetabolomicsanalyseBio-informatica↔ vergelijken
Netwerkgebaseerde padverrijkingsanalyseBio-informatica↔ vergelijken
ProteomicsanalyseBio-informatica↔ vergelijken
RNA-seq Differentiele ExpressieBio-informatica↔ vergelijken
Single-cell RNA-seq AnalyseBio-informatica↔ vergelijken

Naast elkaar vergelijken →

Geciteerd door

Bayesiaanse ChIP-seq Peak Calling Bayesiaanse eQTL-analyse Bayesian gen-set-enrichmentanalyse (Bayesian GSEA)Bayesiaanse GWAS Bayesian Metabolomics Analysis Bayesiaanse Padverrijkingsanalyse Bayesiaanse Proteomicsanalyse Bayesiaanse RNA-seq Differentieel Expressie Differentieel Epigenoom-Wide Associatiestudie Differentieel eQTL-analyse Differentiële Metabolomics Analyse Differentiële Padverrijkingsanalyse Differentiële Proteomicsanalyse Epigenoom-brede associatiestudie (EWAS)eQTL-analyse Gen-setverrijkingsanalyse (GSEA)Genoombrede associatiestudie (GWAS)Machine Learning-Assisted eQTL-Analyse Machine Learning-ondersteunde Genensetverrijkingsanalyse Machine learning-ondersteunde analyse van microbioomdiversiteit Machine Learning-ondersteunde RNA-seq differentiële expressieanalyse Machine learning-ondersteunde analyse van single-cell RNA-seq Metabolomicsanalyse Multi-Omics Epigenoom-Brede Associatiestudie Multi-omics Gene Set Enrichment Analysis Multi-omics metabolomics analyse Multi-omics Microbiële Diversiteitsanalyse Multi-omics proteomicsanalyse Multi-omics single-cell RNA-seq analysis Netwerkgebaseerde Copy Number Variatie-analyse Netwerkgebaseerde Epigenoom-Brede Associatiestudie (Network EWAS)Netwerk-gebaseerde eQTL-analyse Netwerkgebaseerde Genensetverrijkingsanalyse Netwerkgebaseerde GWAS Netwerkgebaseerde Metabolomica Analyse Netwerkgebaseerde analyse van microbiële diversiteit Netwerkgebaseerde RNA-seq analyse van differentiële expressie Netwerkgebaseerde analyse van enkele cel RNA-seq Proteomicsanalyse RNA-seq Differentiele Expressie Single-cell eQTL Analyse Single-cell Gene Set Enrichment Analysis Single-cell GWAS Analyse van metabolomics op enkele cellen Single-cell RNA-seq Analyse Differentiële expressieanalyse van single-cell RNA-seq Tijdreeks Gen Set Enrichement Analyse Tijdreeks Metabolomica Analyse Tijdreeksanalyse van Microbiële Diversiteit Time-Series Pathway Enrichment Analysis Differentiële expressieanalyse van tijdreeks-RNA-seq Analyse van enkelcel-RNA-seq-data over tijd

Een fout op deze pagina gezien? Meld het of stel een correctie voor →