Single-cell GWAS — Cell-Type-Specifieke Genetische Associatieanalyse
Single-cell GWAS is een integratieve bioinformatica-pijplijn die genome-wide associatiestudie (GWAS)-signalen in kaart brengt op single-cell transcriptomische landschappen om te identificeren welke celtypen en individuele cellen onevenredig genetisch risico dragen voor een ziekte of eigenschap. Door gebruik te maken van single-cell RNA-seq atlassen naast GWAS-samenvattingsstatistieken, gaat het verder dan associaties op weefselniveau om de precieze cellulaire contexten te onthullen waarin ziekte-geassocieerde genetische varianten hun effecten uitoefenen.
Lees de volledige methode
Log in met een gratis account om dit onderdeel te lezen.
Methodenkaart
De omgeving van verwante methoden — selecteer een knooppunt om te verkennen.
Bronnen
- Zhang, M. J., Hou, K., Dey, K. K., Sakaue, S., Jagadeesh, K. A., Weinand, K., ... & Price, A. L. (2022). Polygenic enrichment distinguishes disease associations of individual cells in single-cell RNA-seq data. Nature Genetics, 54(8), 1224-1234. link ↗
- Bryois, J., Calini, D., Macnair, W., Foo, L., Urich, E., Ortmann, W., ... & De Jager, P. L. (2022). Cell-type-specific cis-eQTLs in eight human brain cell types identify novel risk genes for psychiatric and neurological disorders. Nature Neuroscience, 25(8), 1104-1112. link ↗
Deze pagina citeren
ScholarGate. (2026, June 3). Single-Cell Genome-Wide Association Study. ScholarGate. https://scholargate.app/nl/bioinformatics/single-cell-gwas
Welke methode?
Plaats deze methode naast haar naaste verwanten en lees ze naast elkaar — de bibliotheek legt de boeken op tafel; de keuze is aan u.
- eQTL-analyseBio-informatica↔ vergelijken
- Genoombrede associatiestudie (GWAS)Bio-informatica↔ vergelijken
- Pathway-verrijkingsanalyseBio-informatica↔ vergelijken
- RNA-seq Differentiele ExpressieBio-informatica↔ vergelijken
- Single-cell eQTL AnalyseBio-informatica↔ vergelijken
- Single-cell RNA-seq AnalyseBio-informatica↔ vergelijken
Geciteerd door
Een fout op deze pagina gezien? Meld het of stel een correctie voor →