Multi-omics Single-Cell RNA Sequencing Analysis

Beschouw elke cel als een persoon beschreven door hun gesproken taal (mRNA), hun bibliotheekkaartgeschiedenis (open chromatine), en de badges op hun jas (oppervlakteproteïnen). Standaard scRNA-seq toont alleen de taal. Multi-omics toont alle drie tegelijk. Omdat elke laag een ander aspect van celbiologie vastlegt, laat het combineren ervan u ambiguïteiten oplossen: twee celclusters die identiek lijken op basis van het transcriptoom kunnen dramatisch verschillen in chromatine-toegankelijkheid, wat duidt op verschillende regulatieprogramma's. De analytische uitdaging is het vinden van een coherente gezamenlijke representatie over lagen die zeer verschillende gegevenstypen, sparsiteiten en schalen bevatten — zonder dat één modaliteit het signaal domineert.