Tijdreeks Gen Set Enrichement Analyse — Dynamische Pathway-verrijking over Tijdspunten
Tijdreeks gen set enrichment analyse (TS-GSEA) breidt het klassieke GSEA-raamwerk uit om biologisch gecoördineerde gen sets – pathways, gen-ontologie termen of samengestelde signatures – te detecteren waarvan de collectieve expressie betekenisvol verandert over de tijd. In plaats van twee momentopnames te vergelijken, modelleert het de volledige temporele trajectorie van genexpressie om te identificeren welke functionele programma's geactiveerd, onderdrukt of dynamisch geherstructureerd worden tijdens een biologisch proces zoals ontwikkeling, behandelingsrespons of ziekteprogressie.
Lees de volledige methode
Log in met een gratis account om dit onderdeel te lezen.
Methodenkaart
De omgeving van verwante methoden — selecteer een knooppunt om te verkennen.
Bronnen
- Subramanian, A., Tamayo, P., Mootha, V. K., Mukherjee, S., Ebert, B. L., Gillette, M. A., Paulovich, A., Pomeroy, S. L., Golub, T. R., Lander, E. S., & Mesirov, J. P. (2005). Gene set enrichment analysis: A knowledge-based approach for interpreting genome-wide expression profiles. Proceedings of the National Academy of Sciences, 102(43), 15545–15550. DOI: 10.1073/pnas.0506580102 ↗
- Nueda, M. J., Tarazona, S., & Conesa, A. (2014). Next maSigPro: updating maSigPro bioconductor package for RNA-seq time series. Bioinformatics, 30(18), 2598–2602. DOI: 10.1093/bioinformatics/btu333 ↗
Deze pagina citeren
ScholarGate. (2026, June 3). Time-Series Gene Set Enrichment Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/nl/bioinformatics/time-series-gene-set-enrichment-analysis
Welke methode?
Plaats deze methode naast haar naaste verwanten en lees ze naast elkaar — de bibliotheek legt de boeken op tafel; de keuze is aan u.
- Gen-setverrijkingsanalyse (GSEA)Bio-informatica↔ vergelijken
- Multi-omics Gene Set Enrichment AnalysisBio-informatica↔ vergelijken
- Pathway-verrijkingsanalyseBio-informatica↔ vergelijken
- RNA-seq Differentiele ExpressieBio-informatica↔ vergelijken
- Single-cell RNA-seq AnalyseBio-informatica↔ vergelijken
- Differentiële expressieanalyse van tijdreeks-RNA-seqBio-informatica↔ vergelijken
Similar methods
Een fout op deze pagina gezien? Meld het of stel een correctie voor →