Process / pipelineBioinformatics / omics

Gen-setverrijkingsanalyse (GSEA)

Gen-setverrijkingsanalyse (GSEA) is een computationele methode die bepaalt of een vooraf gedefinieerde set genen — die een biologische route, proces of functie vertegenwoordigt — statistisch significante, gecoördineerde verschillen vertoont tussen twee biologische condities. In tegenstelling tot eenvoudige fold-change filtering, werkt GSEA op alle gemeten genen die gerangschikt zijn op basis van een correlatiemetriek, en detecteert subtiele maar consistente verschuivingen in een gehele route, zelfs wanneer geen enkel gen een significantiedrempel passeert.

Openen in MethodMindBinnenkortApply, compare, get guidance

Tools & resources

Dia's downloaden

Learn & explore

VideoBinnenkort

Lees de volledige methode

Alleen voor leden

Inloggen

Methodenkaart

De omgeving van verwante methoden — selecteer een knooppunt om te verkennen.

Gen-setverrijkingsanalyse (GSEA)

Multi-omics Gene Set Enr…Netwerkgebaseerde Genens…Pathway-verrijkingsanaly…RNA-seq Differentiele Ex…Single-cell RNA-seq Anal…Bayesian gen-set-enrichm…Bayesian Microbiome Dive…Bayesiaanse Padverrijkin…Bayesiaanse RNA-seq Diff…Differentiële ChIP-seq P…

+27 meer

Bronnen

Subramanian, A., Tamayo, P., Mootha, V. K., Mukherjee, S., Ebert, B. L., Gillette, M. A., Paulovich, A., Pomeroy, S. L., Golub, T. R., Lander, E. S., & Mesirov, J. P. (2005). Gene set enrichment analysis: A knowledge-based approach for interpreting genome-wide expression profiles. Proceedings of the National Academy of Sciences, 102(43), 15545–15550. DOI: 10.1073/pnas.0506580102 ↗
Mootha, V. K., Lindgren, C. M., Eriksson, K. F., Subramanian, A., Sihag, S., Lehar, J., Puigserver, P., Carlsson, E., Ridderstrale, M., Laurila, E., Houstis, N., Daly, M. J., Patterson, N., Mesirov, J. P., Golub, T. R., Tamayo, P., Spiegelman, B., Lander, E. S., Hirschhorn, J. N., Altshuler, D., & Groop, L. C. (2003). PGC-1alpha-responsive genes involved in oxidative phosphorylation are coordinately downregulated in human diabetes. Nature Genetics, 34(3), 267–273. DOI: 10.1038/ng1180 ↗

Deze pagina citeren

ScholarGate. (2026, June 3). Gene Set Enrichment Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/nl/bioinformatics/gene-set-enrichment-analysis

Welke methode?

Plaats deze methode naast haar naaste verwanten en lees ze naast elkaar — de bibliotheek legt de boeken op tafel; de keuze is aan u.

Multi-omics Gene Set Enrichment AnalysisBio-informatica↔ vergelijken
Netwerkgebaseerde GenensetverrijkingsanalyseBio-informatica↔ vergelijken
Pathway-verrijkingsanalyseBio-informatica↔ vergelijken
RNA-seq Differentiele ExpressieBio-informatica↔ vergelijken
Single-cell RNA-seq AnalyseBio-informatica↔ vergelijken

Naast elkaar vergelijken →

Geciteerd door

Bayesian gen-set-enrichmentanalyse (Bayesian GSEA)Bayesian Microbiome Diversity Analysis Bayesiaanse Padverrijkingsanalyse Bayesiaanse RNA-seq Differentieel Expressie Differentiële ChIP-seq Peak Calling Differentiële Padverrijkingsanalyse eQTL-analyse Machine Learning-ondersteunde Genensetverrijkingsanalyse Machine Learning-Assisted Pathway Enrichment Analysis Machine Learning-ondersteunde RNA-seq differentiële expressieanalyse Machine learning-ondersteunde analyse van single-cell RNA-seq Metabolomicsanalyse Multi-omics Gene Set Enrichment Analysis Multi-omics metabolomics analyse Multi-omics Microbiële Diversiteitsanalyse Multi-omics Pathway Enrichment Analysis Multi-omics proteomicsanalyse Multi-omics RNA-seq Differentiële Expressie Analyse Multi-omics single-cell RNA-seq analysis Netwerkgebaseerde Copy Number Variatie-analyse Netwerkgebaseerde Genensetverrijkingsanalyse Netwerkgebaseerde GWAS Netwerkgebaseerde Metabolomica Analyse Netwerkgebaseerde analyse van microbiële diversiteit Netwerkgebaseerde padverrijkingsanalyse Netwerkgebaseerde RNA-seq analyse van differentiële expressie Netwerkgebaseerde analyse van enkele cel RNA-seq Pathway-verrijkingsanalyse Proteomicsanalyse RNA-seq Differentiele Expressie Single-cell Gene Set Enrichment Analysis Single-cell RNA-seq Analyse Differentiële expressieanalyse van single-cell RNA-seq Tijdreeks Gen Set Enrichement Analyse Time-Series Pathway Enrichment Analysis Differentiële expressieanalyse van tijdreeks-RNA-seq Analyse van enkelcel-RNA-seq-data over tijd

Related reference concepts

Pathway Enrichment and Network Analysis Functional Genomics and Pathway Analysis Gene Ontology and Biological Databases Gene Expression Signatures and Prognostic Markers Transcriptomics and Gene Expression Analysis Systems Genomics and Network Biology

Een fout op deze pagina gezien? Meld het of stel een correctie voor →