Netwerkgebaseerde padverrijkingsanalyse
Netwerkgebaseerde padverrijkingsanalyse integreert moleculaire interactienetwerken — eiwit-eiwitinteracties, signaalgrafieken of genregulerende netwerken — met omics-metingen om biologische paden te identificeren die gecoördineerd zijn veranderd in een bepaalde conditie. In tegenstelling tot klassieke oververtegenwoordigings- of gen-setverrijkingsbenaderingen die padgenen als onafhankelijke lijsten behandelen, propageert deze familie van methoden signalen over netwerkranden, waarbij de topologie van interacties wordt vastgelegd en gedereguleerde modules worden ontdekt die platte-lijstverrijking zou missen.
Lees de volledige methode
Log in met een gratis account om dit onderdeel te lezen.
Methodenkaart
De omgeving van verwante methoden — selecteer een knooppunt om te verkennen.
Bronnen
- Ideker, T., Ozier, O., Schwikowski, B., & Siegel, A. F. (2002). Discovering regulatory and signalling circuits in molecular interaction networks. Bioinformatics, 18(suppl_1), S233–S240. link ↗
- Vaske, C. J., Benz, S. C., Sanborn, J. Z., Earl, D., Szeto, C., Zhu, J., Haussler, D., & Stuart, J. M. (2010). Inference of patient-specific pathway activities from multi-dimensional cancer genomics data using PARADIGM. Bioinformatics, 26(12), i237–i245. DOI: 10.1093/bioinformatics/btq182 ↗
Deze pagina citeren
ScholarGate. (2026, June 3). Network-based Pathway Enrichment Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/nl/bioinformatics/network-based-pathway-enrichment-analysis
Welke methode?
Plaats deze methode naast haar naaste verwanten en lees ze naast elkaar — de bibliotheek legt de boeken op tafel; de keuze is aan u.
- Gen-setverrijkingsanalyse (GSEA)Bio-informatica↔ vergelijken
Geciteerd door
Een fout op deze pagina gezien? Meld het of stel een correctie voor →