Netwerkgebaseerde Copy Number Variatie-analyse
Netwerkgebaseerde copy number variatie (CNV)-analyse integreert genoombrede CNV-gegevens met biologische interactienetwerken — zoals eiwit-eiwitinteractie (PPI) of pathway-netwerken — om functioneel coherente regio's, drivergenen en veranderde subnetwerken te identificeren die met alleen ruwe CNV-detectie gemist zouden worden. Door CNV-signalen te propageren via de netwerkgraaf, onthult de methode gecoördineerde genomische dosis-onevenwichtigheden die convergeren op gemeenschappelijke biologische functies, waardoor het bijzonder krachtig is in kankergenomica en studies naar zeldzame ziekten.
Lees de volledige methode
Log in met een gratis account om dit onderdeel te lezen.
Methodenkaart
De omgeving van verwante methoden — selecteer een knooppunt om te verkennen.
Bronnen
- Vandin, F., Upfal, E., & Raphael, B. J. (2012). De novo discovery of mutated driver pathways in cancer. Genome Research, 22(2), 375–385. DOI: 10.1101/gr.120477.111 ↗
- Leiserson, M. D. M., Vandin, F., Wu, H.-T., Dobson, J. R., Eldridge, J. V., Thomas, J. L., Papoutsaki, A., Kim, Y., Niu, B., McLellan, M., Lawrence, M. S., Gonzalez-Perez, A., Tamborero, D., Cheng, Y., Ryslik, G. A., Lopez-Bigas, N., Getz, G., Ding, L., & Raphael, B. J. (2015). Pan-cancer network analysis identifies combinations of rare somatic mutations across pathways and protein complexes. Nature Genetics, 47(2), 106–114. DOI: 10.1038/ng.3168 ↗
Deze pagina citeren
ScholarGate. (2026, June 3). Network-Based Copy Number Variation Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/nl/bioinformatics/network-based-copy-number-variation-analysis
Welke methode?
Plaats deze methode naast haar naaste verwanten en lees ze naast elkaar — de bibliotheek legt de boeken op tafel; de keuze is aan u.
- Analyse van kopienummervariatieBio-informatica↔ vergelijken
- Gen-setverrijkingsanalyse (GSEA)Bio-informatica↔ vergelijken
- Netwerkgebaseerde GWASBio-informatica↔ vergelijken
- Netwerkgebaseerde RNA-seq analyse van differentiële expressieBio-informatica↔ vergelijken
- Pathway-verrijkingsanalyseBio-informatica↔ vergelijken
- Variant CallingBio-informatica↔ vergelijken
Een fout op deze pagina gezien? Meld het of stel een correctie voor →