ScholarGate
Assistent
Process / pipelineBioinformatics / omics

Analyse van enkelcel-RNA-seq-data over tijd — Temporale transcriptomica met resolutie op enkelcelniveau

Tijdreeksanalyse van enkelcel-RNA-seq (scRNA-seq) legt genexpressie vast over meerdere tijdspunten met resolutie op enkelcelniveau om te onthullen hoe celpopulaties ontstaan, overgaan en divergeren tijdens dynamische biologische processen zoals ontwikkeling, differentiatie of ziekteprogressie. Door pseudotijdordening, RNA-snelheid en testen van differentiële dynamiek te combineren, reconstrueren onderzoekers de temporele trajectorie van individuele cellen en identificeren ze de genregulerende veranderingen die biologische transities aansturen.

Openen in MethodMindBinnenkortApply, compare, get guidance
Tools & resources
Dia's downloaden
Learn & explore
VideoBinnenkort

Lees de volledige methode

Alleen voor leden

Log in met een gratis account om dit onderdeel te lezen.

Inloggen

Methodenkaart

De omgeving van verwante methoden — selecteer een knooppunt om te verkennen.

Analyse van enkelcel-RNA-seq-data over tijd
Analyse van kopienummerv…eQTL-analyseGen-setverrijkingsanalys…Pathway-verrijkingsanaly…RNA-seq Differentiele Ex…Single-cell RNA-seq Anal…Tijdreeks-Epigenoombrede…

Bronnen

  1. Trapnell, C., Cacchiarelli, D., Grimsby, J., Pokharel, P., Li, S., Morse, M., Lennon, N. J., Livak, K. J., Mikkelsen, T. S., & Rinn, J. L. (2014). The dynamics and regulators of cell fate decisions are revealed by pseudotemporal ordering of single cells. Nature Biotechnology, 32(4), 381-386. DOI: 10.1038/nbt.2859 ↗
  2. La Manno, G., Soldatov, R., Zeisel, A., Braun, E., Hochgerner, H., Petukhov, V., Lidschreiber, K., Kastriti, M. E., Lonnerberg, P., Furlan, A., Fan, J., Borm, L. E., Liu, Z., van Bruggen, D., Guo, J., He, X., Linnarsson, S., & Kharchenko, P. V. (2018). RNA velocity of single cells. Nature, 560(7719), 494-498. DOI: 10.1038/s41586-018-0414-6 ↗

Deze pagina citeren

ScholarGate. (2026, June 3). Time-Series Single-Cell RNA Sequencing Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/nl/bioinformatics/time-series-single-cell-rna-seq-analysis

Welke methode?

Plaats deze methode naast haar naaste verwanten en lees ze naast elkaar — de bibliotheek legt de boeken op tafel; de keuze is aan u.

Naast elkaar vergelijken →

Geciteerd door

Tijdreeks-Epigenoombrede Associatiestudie

Similar methods

Single-cell RNA-seq analysisRNA VelocityTime-series RNA-seq differential expressionDifferential single-cell RNA-seq analysisSingle-cell RNA-seq differential expressionTime-series eQTL analysisMulti-omics single-cell RNA-seq analysisSingle-cell Phylogenetic Analysis

Related reference concepts

Single-Cell and Spatial TranscriptomicsTranscriptomics and Gene Expression AnalysisRNA Sequencing Methods and TechnologiesRNA Sequencing and TranscriptomicsDNA and RNA Sequencing MethodsNext-Generation Sequencing Technologies

Een fout op deze pagina gezien? Meld het of stel een correctie voor →

ScholarGate — Time-series single-cell RNA-seq analysis (Time-Series Single-Cell RNA Sequencing Analysis). Geraadpleegd op 2026-06-15 via https://scholargate.app/nl/bioinformatics/time-series-single-cell-rna-seq-analysis · Gegevensset: https://doi.org/10.5281/zenodo.20539026