Bayesiaanse ChIP-seq Peak Calling — Probabilistische Verrijkingsdetectie in Epigenomische Data

Bayesiaanse ChIP-seq peak calling past probabilistische modellen toe — doorgaans Poisson-, negatief-binominale of verborgen Markov-modellen met Bayesiaanse inferentie — om genomische regio's te detecteren die verrijkt zijn met een eiwit van belang in chromatine-immunoprecipitatie gevolgd door sequencing-experimenten. Door expliciet ruis in read-counts te modelleren en a priori-verdelingen op te nemen, leveren Bayesiaanse callers posterieure waarschijnlijkheden van verrijking op in plaats van eenvoudige p-waarden, wat een principieel kader biedt voor kwantificering van onzekerheid over het genoom.