ScholarGate
Assistent
Process / pipelineBioinformatics / omics

Netwerkgebaseerde analyse van enkele cel RNA-seq

Netwerkgebaseerde analyse van enkele cel RNA-seq breidt standaard scRNA-seq workflows uit door moleculaire interactienetwerken — genregulerende netwerken, co-expressienetwerken of cel-cel communicatiegrafieken — te construeren en te bevragen uit transcriptomische gegevens van enkele cellen. In plaats van elk gen onafhankelijk te behandelen, vangt deze benadering de gecoördineerde activiteit van gencircuits en intercellulaire signaalpaden binnen en tussen celpopulaties op, wat een systeemgericht beeld van transcriptionele regulatie op resolutie van enkele cellen mogelijk maakt.

Openen in MethodMindBinnenkortVideoBinnenkortDia's downloaden

Lees de volledige methode

Alleen voor leden

Log in met een gratis account om dit onderdeel te lezen.

Inloggen

Methodenkaart

De omgeving van verwante methoden — selecteer een knooppunt om te verkennen.

Bronnen

  1. Aibar, S., González-Blas, C. B., Moerman, T., Huynh-Thu, V. A., Imrichova, H., Hulselmans, G., ... & Aerts, S. (2017). SCENIC: single-cell regulatory network inference and clustering. Nature Methods, 14(11), 1083–1086. link
  2. Jin, S., Guerrero-Juarez, C. F., Zhang, L., Chang, I., Ramos, R., Kuan, C. H., ... & Nie, Q. (2021). Inference and analysis of cell-cell communication using CellChat. Nature Communications, 12(1), 1088. link

Deze pagina citeren

ScholarGate. (2026, June 3). Network-based Single-Cell RNA Sequencing Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/nl/bioinformatics/network-based-single-cell-rna-seq-analysis

Welke methode?

Plaats deze methode naast haar naaste verwanten en lees ze naast elkaar — de bibliotheek legt de boeken op tafel; de keuze is aan u.

Naast elkaar vergelijken
ScholarGateNetwork-based single-cell RNA-seq analysis (Network-based Single-Cell RNA Sequencing Analysis). Geraadpleegd op 2026-06-15 via https://scholargate.app/nl/bioinformatics/network-based-single-cell-rna-seq-analysis · Gegevensset: https://doi.org/10.5281/zenodo.20539026