Bayesiaanse Padverrijkingsanalyse

Bayesiaanse padverrijkingsanalyse test of een vooraf gedefinieerde set genen — een biologisch pad — systematisch oververtegenwoordigd is onder genen die bewijs van differentiële activiteit vertonen in een experiment. In tegenstelling tot klassieke oververtegenwoordigingstesten, codeert het voorafgaande biologische kennis als een prior-verdeling en werkt deze bij met de waargenomen expressiedata, wat resulteert in posterieure waarschijnlijkheden van verrijking in plaats van p-waarden. Dit probabilistische kader behandelt kleine steekproeven, meerdere paden en onzekerheidspropagatie op een coherente statistische manier.