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Análisis de Enriquecimiento de Conjuntos de Genes (GSEA)

El Análisis de Enriquecimiento de Conjuntos de Genes (GSEA) es un método computacional que determina si un conjunto predefinido de genes — que representa una vía biológica, proceso o función — muestra diferencias coordinadas y estadísticamente significativas entre dos condiciones biológicas. A diferencia del simple filtrado por cambio de pliegue (fold-change), GSEA opera sobre todos los genes medidos, clasificados por una métrica de correlación, detectando cambios sutiles pero consistentes en una vía completa, incluso cuando ningún gen individual supera un umbral de significancia.

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Fuentes

Subramanian, A., Tamayo, P., Mootha, V. K., Mukherjee, S., Ebert, B. L., Gillette, M. A., Paulovich, A., Pomeroy, S. L., Golub, T. R., Lander, E. S., & Mesirov, J. P. (2005). Gene set enrichment analysis: A knowledge-based approach for interpreting genome-wide expression profiles. Proceedings of the National Academy of Sciences, 102(43), 15545–15550. DOI: 10.1073/pnas.0506580102 ↗
Mootha, V. K., Lindgren, C. M., Eriksson, K. F., Subramanian, A., Sihag, S., Lehar, J., Puigserver, P., Carlsson, E., Ridderstrale, M., Laurila, E., Houstis, N., Daly, M. J., Patterson, N., Mesirov, J. P., Golub, T. R., Tamayo, P., Spiegelman, B., Lander, E. S., Hirschhorn, J. N., Altshuler, D., & Groop, L. C. (2003). PGC-1alpha-responsive genes involved in oxidative phosphorylation are coordinately downregulated in human diabetes. Nature Genetics, 34(3), 267–273. DOI: 10.1038/ng1180 ↗

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ScholarGate. (2026, June 3). Gene Set Enrichment Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/es/bioinformatics/gene-set-enrichment-analysis

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Análisis de Enriquecimiento de Conjuntos de Genes Multi-ómicoBioinformática↔ comparar
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Análisis bayesiano de enriquecimiento de conjuntos de genes Análisis Bayesiano de Diversidad del Microbioma Análisis bayesiano de enriquecimiento de vías Análisis Bayesiano de Expresión Diferencial de ARNseq Llamada de picos diferencial de ChIP-seq Análisis diferencial de enriquecimiento de vías Análisis de eQTL Machine learning-assisted gene set enrichment analysis Análisis de Enriquecimiento de Vías Asistido por Aprendizaje Automático Análisis de Expresión Diferencial de RNA-seq Asistido por Aprendizaje Automático Análisis de ARN unicelular asistido por aprendizaje automático Análisis de Metabolómica Análisis de Enriquecimiento de Conjuntos de Genes Multi-ómico Análisis Multi-ómico de Metabolómica Análisis de Diversidad del Microbioma Multi-ómico Análisis de Enriquecimiento de Vías Multi-ómicas Análisis multiómico de proteómica Análisis de Expresión Diferencial de ARN-seq Multi-ómico Análisis multiómico de ARN de célula única Análisis de Variación del Número de Copias Basado en Redes Análisis de enriquecimiento de conjuntos de genes basado en redes GWAS basada en redes Análisis metabolómico basado en redes Análisis de Diversidad del Microbioma Basado en Redes Análisis de Enriquecimiento de Vías Basado en Redes Análisis de Expresión Diferencial de RNA-seq Basado en Redes Análisis de ARN-seq de célula única basado en redes Análisis de Enriquecimiento de Vías Análisis de Proteómica Expresión Diferencial de RNA-seq Análisis de Enriquecimiento de Conjuntos de Genes a Nivel de Célula Única Análisis de scRNA-seq Análisis de Expresión Diferencial de ARN-seq de Célula Única Análisis de Enriquecimiento de Conjuntos de Genes en Series Temporales Análisis de Enriquecimiento de Vías de Series Temporales Expresión Diferencial de RNA-seq de Series Temporales Análisis de ARN-seq unicelular de series temporales

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