Análisis de enriquecimiento de conjuntos de genes basado en redes

El análisis de enriquecimiento de conjuntos de genes basado en redes (network GSEA) extiende el GSEA clásico al incorporar redes de interacción biológica —como gráficos de interacción proteína-proteína (PPI) o de coexpresión— en la prueba de enriquecimiento. En lugar de tratar cada gen de forma independiente, el método propaga señales de expresión diferencial a través de los bordos de la red, permitiendo que genes co-regulados o funcionalmente conectados apoyen conjuntamente la significancia de un conjunto de genes. El resultado es una puntuación de enriquecimiento biológicamente coherente que tiene en cuenta la topología de la vía y las dependencias entre genes.