Análisis de Enriquecimiento de Conjuntos de Genes a Nivel de Célula Única — scGSEA
El análisis de enriquecimiento de conjuntos de genes a nivel de célula única (scGSEA) extiende el GSEA clásico de ARN-seq a granel a la resolución de células individuales. En lugar de probar si un conjunto de genes está enriquecido en una comparación a nivel de muestra, scGSEA asigna una puntuación de enriquecimiento o actividad a cada célula, lo que permite a los investigadores mapear la actividad de vías en poblaciones celulares heterogéneas, estados celulares y trayectorias de desarrollo capturadas en datos de ARN-seq de célula única.
Leer el método completo
Inicia sesión con una cuenta gratuita para leer esta sección.
Mapa de métodos
El vecindario de métodos relacionados: selecciona un nodo para explorarlo.
Fuentes
- Aibar, S., Gonzalez-Blas, C. B., Moerman, T., Huynh-Thu, V. A., Imrichova, H., Hulselmans, G., Rambow, F., Marine, J.-C., Geurts, P., Aerts, J., van den Oord, J., Kalender Atak, Z., Wouters, J., & Aerts, S. (2017). SCENIC: Single-cell regulatory network inference and clustering. Nature Methods, 14(11), 1083-1086. link ↗
- DeTomaso, D., Jones, M. G., Subramaniam, M., Ashuach, T., Ye, C. J., & Yosef, N. (2019). Functional interpretation of single cell similarity maps. Nature Communications, 10(1), 4376. link ↗
Cómo citar esta página
ScholarGate. (2026, June 3). Single-cell Gene Set Enrichment Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/es/bioinformatics/single-cell-gene-set-enrichment-analysis
¿Qué método?
Coloca este método junto a sus parientes más cercanos y léelos lado a lado: la biblioteca pone los libros sobre la mesa; la elección es tuya.
- Análisis de Enriquecimiento de Conjuntos de Genes (GSEA)Bioinformática↔ comparar
- Análisis de Enriquecimiento de VíasBioinformática↔ comparar
- Expresión Diferencial de RNA-seqBioinformática↔ comparar
- Análisis de scRNA-seqBioinformática↔ comparar
- Análisis de Expresión Diferencial de ARN-seq de Célula ÚnicaBioinformática↔ comparar
Citado por
Similar methods
¿Has visto un problema en esta página? Infórmanos o sugiere una corrección →