Análisis de Enriquecimiento de Vías Basado en Redes
El análisis de enriquecimiento de vías basado en redes integra redes de interacción molecular —interacciones proteína-proteína, grafos de señalización o redes reguladoras génicas— con mediciones ómicas para identificar vías biológicas que se alteran coordinadamente en una condición. A diferencia de los enfoques clásicos de sobrerrepresentación o enriquecimiento de conjuntos de genes que tratan los genes de las vías como listas independientes, esta familia de métodos propaga señales a través de los bordes de la red, capturando la topología de las interacciones y descubriendo módulos desregulados que el enriquecimiento de listas planas pasaría por alto.
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Fuentes
- Ideker, T., Ozier, O., Schwikowski, B., & Siegel, A. F. (2002). Discovering regulatory and signalling circuits in molecular interaction networks. Bioinformatics, 18(suppl_1), S233–S240. link ↗
- Vaske, C. J., Benz, S. C., Sanborn, J. Z., Earl, D., Szeto, C., Zhu, J., Haussler, D., & Stuart, J. M. (2010). Inference of patient-specific pathway activities from multi-dimensional cancer genomics data using PARADIGM. Bioinformatics, 26(12), i237–i245. DOI: 10.1093/bioinformatics/btq182 ↗
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ScholarGate. (2026, June 3). Network-based Pathway Enrichment Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/es/bioinformatics/network-based-pathway-enrichment-analysis
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