Análisis de Variación del Número de Copias Basado en Redes
El análisis de variación del número de copias (VNC) basado en redes integra datos de VNC a nivel de genoma completo con redes de interacción biológica — como redes de interacción proteína-proteína (IPP) o de vías — para identificar regiones funcionalmente coherentes, genes impulsores y subredes alteradas que la simple detección de VNC bruta pasaría por alto. Al propagar las señales de VNC a través del grafo de la red, el método revela desequilibrios coordinados de dosis genómica que convergen en funciones biológicas comunes, lo que lo hace especialmente potente en genómica del cáncer y estudios de enfermedades raras.
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Fuentes
- Vandin, F., Upfal, E., & Raphael, B. J. (2012). De novo discovery of mutated driver pathways in cancer. Genome Research, 22(2), 375–385. DOI: 10.1101/gr.120477.111 ↗
- Leiserson, M. D. M., Vandin, F., Wu, H.-T., Dobson, J. R., Eldridge, J. V., Thomas, J. L., Papoutsaki, A., Kim, Y., Niu, B., McLellan, M., Lawrence, M. S., Gonzalez-Perez, A., Tamborero, D., Cheng, Y., Ryslik, G. A., Lopez-Bigas, N., Getz, G., Ding, L., & Raphael, B. J. (2015). Pan-cancer network analysis identifies combinations of rare somatic mutations across pathways and protein complexes. Nature Genetics, 47(2), 106–114. DOI: 10.1038/ng.3168 ↗
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ScholarGate. (2026, June 3). Network-Based Copy Number Variation Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/es/bioinformatics/network-based-copy-number-variation-analysis
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