Llamada de picos diferencial de ChIP-seq — Análisis comparativo de la unión a la cromatina
La llamada de picos diferencial de ChIP-seq identifica loci genómicos donde una proteína de interés —típicamente un factor de transcripción o una marca de histona— muestra una unión u ocupación significativamente alterada entre dos o más condiciones biológicas. Al combinar la detección estándar de picos de ChIP-seq con pruebas estadísticas basadas en recuentos, el método revela elementos reguladores específicos de la condición, proporcionando un mapa a escala genómica de las interacciones dinámicas de la cromatina que subyacen a los cambios en el estado celular.
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Fuentes
- Ross-Innes, C. S., Stark, R., Teschendorff, A. E., Holmes, K. A., Ali, H. R., Dunning, M. J., Brown, G. D., Gojis, O., Ellis, I. O., Green, A. R., Ali, S., Chin, S. F., Palmieri, C., Caldas, C., & Carroll, J. S. (2012). Differential oestrogen receptor binding is associated with clinical outcome in breast cancer. Nature, 481(7381), 389-393. link ↗
- Stark, R., & Brown, G. (2011). DiffBind: differential binding analysis of ChIP-Seq peak data. Bioconductor Package, Cancer Research UK Cambridge Research Institute. link ↗
Cómo citar esta página
ScholarGate. (2026, June 3). Differential Chromatin Immunoprecipitation Sequencing Peak Calling. ScholarGate. https://scholargate.app/es/bioinformatics/differential-chip-seq-peak-calling
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