Análisis de scRNA-seq — scRNA-seq
El análisis de secuenciación de ARN de célula única (scRNA-seq, por sus siglas en inglés) caracteriza la expresión génica a la resolución de células individuales, lo que permite descubrir tipos, estados y transiciones celulares que son invisibles en la transcriptómica a granel. A partir de lecturas de secuenciación crudas, el flujo de trabajo produce una matriz de recuentos de célula por gen y procede a través del control de calidad, normalización, reducción de dimensionalidad, agrupamiento no supervisado, anotación de tipos celulares y una variedad de análisis posteriores, como la inferencia de trayectorias y la expresión diferencial entre poblaciones celulares.
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Fuentes
- Satija, R., Farrell, J. A., Gennert, D., Schier, A. F., & Regev, A. (2015). Spatial reconstruction of single-cell gene expression data. Nature Biotechnology, 33(5), 495–502. DOI: 10.1038/nbt.3192 ↗
- Macosko, E. Z., Basu, A., Satija, R., Nemesh, J., Shekhar, K., Goldman, M., ... & McCarroll, S. A. (2015). Highly parallel genome-wide expression profiling of individual cells using nanoliter droplets. Cell, 161(5), 1202–1214. DOI: 10.1016/j.cell.2015.05.002 ↗
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ScholarGate. (2026, June 3). Single-cell RNA Sequencing Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/es/bioinformatics/single-cell-rna-seq-analysis
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