المعلوماتية الحيوية

112 طرق في هذه العائلة.

مميزة

تحليل الخلط السكانيAdmixture analysis is a population genetics method that infers population structure and individual ancestry from multilocus genotype data. Originally developed by Pritchard, Stephe إعادة بناء الحالة السلفيةAncestral state reconstruction (ASR) is a phylogenetic method that infers the character states (trait values or evolutionary features) of extinct ancestors by analyzing patterns of تحليل تسلسل الكروماتين المتاح (ATAC-seq)ATAC-seq (Assay for Transposase-Accessible Chromatin using sequencing) is a method for profiling the landscape of chromatin accessibility genome-wide. Developed by Buenrostro and c استدعاء قمم ChIP-seqChIP-seq peak calling is a computational pipeline that identifies genomic regions where a protein of interest — a transcription factor or histone modification — is enriched, based نظرية الائتلافCoalescent theory is a probabilistic framework that traces the genealogical history of DNA sequences backward in time to their most recent common ancestor. Developed by John Kingma تحليل تغاير عدد النسخCopy number variation (CNV) analysis is a genomic pipeline for detecting regions where individuals carry fewer or more copies of a DNA segment than the reference genome. CNVs span

مسار القراءة

أكثر مناهج هذا الموضوع تأسيساً ومرجعيةً، مرتَّبةً بحسب تطوّرها التاريخي — نقطة انطلاق مناسبة إن كنت جديداً هنا.

تحليل تغاير عدد النسخ1998–2006بقلم Pinkel et al. (array CGH); Redon et al. (genome-wide CNV map)
تحليل إثراء المسارات2003–2005بقلم Mootha et al. (2003); systematised by Subramanian et al. (2005)
تحليل إثراء مجموعات الجينات (GSEA)2005 (seminal PNAS paper; predecessor concept in Mootha et al. 2003)بقلم Aravind Subramanian, Pablo Tamayo, Vamsi K. Mootha, Jill P. Mesirov, Todd R. Golub, Eric S. Lander et al. (Broad Institute)
دراسة الارتباط على مستوى الجينوم (GWAS)2005–2007بقلم Klein et al. (age-related macular degeneration GWAS, 2005); landmark scale: Wellcome Trust Case Control Consortium (2007)
دراسة الارتباط على مستوى الجينوم الفوقي (EWAS)2008–2011 (term and framework established c. 2011)بقلم Rakyan, Down, Balding & Beck (conceptual framework); Illumina arrays enabled large-scale application
تحليل التعبير التفاضلي لتسلسل الحمض النووي الريبوزي (RNA-seq DE)2008–2010 (RNA-seq DE methodology established)بقلم Multiple groups; foundational methods from Anders & Huber (DESeq, 2010), Robinson, McCarthy & Smyth (edgeR, 2010)
تحليل تسلسل الحمض النووي الريبوزي للخلايا المفردة2009 (first scRNA-seq by Tang et al.); widely adopted 2015–2016بقلم Azim Surani, Barbara Treutlein, and the Regev/McCarroll groups (foundational droplet-based methods ~2015)
استدعاء المتغيرات2009–2010 (modern high-throughput era)بقلم Li et al. (SAMtools/bcftools, 2009); McKenna et al. (GATK, 2010)

جميع المناهج على هذا الرف ↓

جميع الطرق 112

المعلوماتية الحيوية

مميزة

مسار القراءة

جميع الطرق 112

المزيد في معالجة الإشارات والحوسبة العلمية