استدعاء قمم ChIP-seq — استدعاء قمم ترسيب المناعة الكروماتينية بالتسلسل
استدعاء قمم ChIP-seq هو خط أنابيب حسابي يحدد المناطق الجينومية التي يتركز فيها بروتين معين - عامل نسخ أو تعديل هيستوني - بناءً على قراءات التسلسل من تجارب ترسيب المناعة الكروماتينية. يقوم بتحويل بيانات التسلسل الخام إلى مجموعة من مواقع الارتباط أو التعديل عالية الثقة عبر الجينوم، مما يتيح التحليل اللاحق لتنظيم الجينات، وحالة الكروماتين، وآليات ما فوق الجينات.
اقرأ الطريقة كاملة
سجّل الدخول بحساب مجاني لقراءة هذا القسم.
Method map
The neighbourhood of related methods — select a node to explore.
+3 more
المصادر
- Zhang, Y., Liu, T., Meyer, C. A., Eeckhoute, J., Johnson, D. S., Bernstein, B. E., Nusbaum, C., Myers, R. M., Brown, M., Li, W., & Liu, X. S. (2008). Model-based analysis of ChIP-seq (MACS). Genome Biology, 9(9), R137. DOI: 10.1186/gb-2008-9-9-r137 ↗
- Landt, S. G., Marinov, G. K., Kundaje, A., Kheradpour, P., Pauli, F., Batzoglou, S., Bernstein, B. E., Bickel, P., Brown, J. B., Cayting, P., Chen, Y., DeSalvo, G., Epstein, C., Fisher-Aylor, K. I., Euskirchen, G., Gerstein, M., Gertz, J., Hartemink, A. J., Hoffman, M. M., ... Snyder, M. (2012). ChIP-seq guidelines and practices of the ENCODE and modENCODE consortia. Genome Research, 22(9), 1813–1831. DOI: 10.1101/gr.136184.111 ↗
كيف تستشهد بهذه الصفحة
ScholarGate. (2026, June 3). Chromatin Immunoprecipitation Sequencing Peak Calling. ScholarGate. https://scholargate.app/ar/bioinformatics/chip-seq-peak-calling
Which method?
Set this method beside its closest kin and read them side by side — the library lays the books on the table; the choice is yours.
- تحليل تسلسل الكروماتين المتاح (ATAC-seq)علم الوراثة↔ compare
- دراسة الارتباط على مستوى الجينوم الفوقي (EWAS)المعلوماتية الحيوية↔ compare
- تحليل التعبير التفاضلي لتسلسل الحمض النووي الريبوزي (RNA-seq DE)المعلوماتية الحيوية↔ compare
- محاذاة التسلسلاتالمعلوماتية الحيوية↔ compare
- تحليل تسلسل الحمض النووي الريبوزي للخلايا المفردةالمعلوماتية الحيوية↔ compare
- استدعاء المتغيراتالمعلوماتية الحيوية↔ compare