محاذاة تسلسل الخلية الواحدة — ربط قراءات تسلسل الحمض النووي الريبوزي للخلية الواحدة (scRNA-seq)
محاذاة تسلسل الخلية الواحدة هي الخطوة الحاسوبية التي تربط ملايين القراءات التسلسلية القصيرة الناتجة عن تجارب تسلسل الحمض النووي الريبوزي للخلية الواحدة (scRNA-seq) بجينوم أو نسالة مرجعية. على عكس محاذاة تسلسل الحمض النووي الريبوزي بالجملة (bulk RNA-seq)، تحمل كل قراءة شفرة خلية ومعرف جزيئي فريد (UMI) يحددان معًا الخلية الأصلية وجزيء الحمض النووي الريبوزي الفردي. تعد المحاذاة الدقيقة وفك ترميز الشفرات المتعددة متطلبات أساسية لبناء مصفوفة العد للخلية مقابل الجين التي توجه جميع تحليلات الخلية الواحدة اللاحقة.
اقرأ الطريقة كاملة
سجّل الدخول بحساب مجاني لقراءة هذا القسم.
Method map
The neighbourhood of related methods — select a node to explore.
المصادر
- Dobin, A., Davis, C. A., Schlesinger, F., Drenkow, J., Zaleski, C., Jha, S., Batut, P., Chaisson, M., & Gingeras, T. R. (2013). STAR: ultrafast universal RNA-seq aligner. Bioinformatics, 29(1), 15–21. DOI: 10.1093/bioinformatics/bts635 ↗
- Smith, T., Heger, A., & Sudbery, I. (2017). UMI-tools: modeling sequencing errors in Unique Molecular Identifiers to improve quantification accuracy. Genome Research, 27(3), 491–499. DOI: 10.1101/gr.209601.116 ↗
كيف تستشهد بهذه الصفحة
ScholarGate. (2026, June 3). Single-cell RNA-seq Sequence Alignment. ScholarGate. https://scholargate.app/ar/bioinformatics/single-cell-sequence-alignment
Which method?
Set this method beside its closest kin and read them side by side — the library lays the books on the table; the choice is yours.
- تحليل التعبير التفاضلي لتسلسل الحمض النووي الريبوزي (RNA-seq DE)المعلوماتية الحيوية↔ compare