Process / pipelineTranscriptomics
تجميع النسخ المبتسر من الصفر
يُعيد تجميع النسخ المبتسر من الصفر (De novo transcriptome assembly) بناء متواليات الحمض النووي الريبوزي المرسال (mRNA) كاملة الطول مباشرةً من قراءات التسلسل دون الحاجة إلى جينوم مرجعي. وقد أدت هذه المنهجية، التي رادها ريغيف وهاس وزملاؤهما، إلى اكتشاف النسخ في الكائنات غير النموذجية والكشف عن الأشكال المتغيرة الجديدة (isoforms) والجينات الاندماجية (fusion genes) والمتغيرات الملتصقة (splice variants).
اقرأ الطريقة كاملة
للأعضاء فقط
تسجيل الدخولسجّل الدخول بحساب مجاني لقراءة هذا القسم.
خريطة المناهج
محيط المناهج ذات الصلة — اختر عقدةً للاستكشاف.
المصادر
- Grabherr, M. G., Haas, B. J., Yassour, M., Levin, J. Z., Thompson, D. A., Amit, I., ... & Regev, A. (2011). Full-length transcriptome assembly from RNA-Seq data without a reference genome. Nature Biotechnology, 29(7), 644-652. DOI: 10.1038/nbt.1883 ↗
- Haas, B. J., Papanicolaou, A., Yassour, M., Grabherr, M., Blood, P. D., Bowden, J., ... & Regev, A. (2013). De novo transcript sequence reconstruction from RNA-seq using the Trinity platform for reference generation and analysis. Nature Protocols, 8(8), 1494-1512. DOI: 10.1038/nprot.2013.084 ↗
- Pertea, M., Pertea, G. M., Antonescu, C. M., Chang, T. C., Mendell, J. T., & Salzberg, S. L. (2015). StringTie enables improved assembly of novel transcripts from RNA-seq data. Nature Biotechnology, 33(3), 290-295. link ↗
كيف تستشهد بهذه الصفحة
ScholarGate. (2026, June 3). De Novo RNA-Seq Transcriptome Assembly. ScholarGate. https://scholargate.app/ar/bioinformatics/de-novo-transcriptome-assembly
أيُّ منهج؟
ضع هذا المنهج إلى جانب أقرب نظائره واقرأهما جنباً إلى جنب — المكتبة تضع الكتب على الطاولة، والاختيار لك.
- تحليل شاشات كريسبرالمعلوماتية الحيوية↔ قارن
- بحث HMMER Profileالمعلوماتية الحيوية↔ قارن
- تجزئة الميتاجينومالمعلوماتية الحيوية↔ قارن