تحليل تسلسل الكروماتين المتاح (ATAC-seq)
ATAC-seq (Assay for Transposase-Accessible Chromatin using sequencing) هي طريقة لتوصيف مشهد إمكانية الوصول إلى الكروماتين على مستوى الجينوم بأكمله. طورت بواسطة بوينروسترو وزملاؤه في عام 2013، تستخدم ATAC-seq إنزيم ترانسفراز عالي النشاط لوضع علامات على مناطق الكروماتين المفتوحة والمتاحة، مما يتيح تحديدًا سريعًا وحساسًا لعناصر الحمض النووي التنظيمية. أصبحت ATAC-seq تقنية قياسية لتوصيف المشاهد التنظيمية للجينات، واكتشاف العناصر التنظيمية الخاصة بنوع الخلية، واستنتاج شبكات تنظيم الجينات.
اقرأ الطريقة كاملة
سجّل الدخول بحساب مجاني لقراءة هذا القسم.
Method map
The neighbourhood of related methods — select a node to explore.
المصادر
- Buenrostro, J. D., Giresi, P. G., Zaba, L. C., Chang, H. Y., & Greenleaf, W. J. (2013). Transposition of native chromatin for fast and sensitive epigenomic profiling of cell populations and tissues. Nature Methods, 10(12), 1213–1218. link ↗
- Corces, M. R., Buenrostro, J. D., Wu, B., Greenside, P. G., Chan, S. M., Koenig, J. L., & Greenleaf, W. J. (2017). Lineage-specific and single-cell chromatin accessibility charts human hematopoiesis. Nature Genetics, 48(10), 1193–1203. DOI: 10.1038/ng.3646 ↗
- Satpathy, A. T., Granja, J. M., Yost, K. E., Qi, Y., Meschi, F., McDermott, G. P., & Chang, H. Y. (2019). Massively parallel single-cell chromatin landscapes. Nature Biotechnology, 37(12), 1452–1462. link ↗
كيف تستشهد بهذه الصفحة
ScholarGate. (2026, June 3). ATAC-seq Analysis for Chromatin Accessibility and Regulatory Landscapes. ScholarGate. https://scholargate.app/ar/genetics/atac-seq-analysis
Which method?
Set this method beside its closest kin and read them side by side — the library lays the books on the table; the choice is yours.
- تحليل Hi-Cعلم الوراثة↔ compare
- سرعة الحمض النووي الريبوزي (RNA Velocity)علم الوراثة↔ compare