Аналіз збагачення шляхів — Аналіз збагачення біологічних шляхів
Аналіз збагачення шляхів (PEA) — це статистичний підхід, який бере список генів або білків, що становлять інтерес (зазвичай отриманий в результаті експерименту з диференціальною експресією або протеоміки), і визначає, які заздалегіднь визначені біологічні шляхи або функціональні набори генів представлені частіше, ніж очікувалося випадково. Шляхом відображення індивідуальних молекулярних змін на куровані бази знань про шляхи, такі як KEGG, Gene Ontology або Reactome, PEA перетворює довгі списки генів на інтерпретовані біологічні процеси, що робить його центральним інструментом у постаналізі високопродуктивних оміксних експериментів.
Читати метод повністю
Увійдіть із безкоштовним обліковим записом, щоб прочитати цей розділ.
Карта методів
Околиця споріднених методів — виберіть вузол, щоб дослідити.
+ще 43
Джерела
- Subramanian, A., Tamayo, P., Mootha, V. K., Mukherjee, S., Ebert, B. L., Gillette, M. A., Paulovich, A., Pomeroy, S. L., Golub, T. R., Lander, E. S., & Mesirov, J. P. (2005). Gene set enrichment analysis: A knowledge-based approach for interpreting genome-wide expression profiles. Proceedings of the National Academy of Sciences, 102(43), 15545–15550. DOI: 10.1073/pnas.0506580102 ↗
- Alexa, A., Rahnenführer, J., & Lengauer, T. (2006). Improved scoring of functional groups from gene expression data by decorrelating GO graph structure. Bioinformatics, 22(13), 1600–1607. DOI: 10.1093/bioinformatics/btl140 ↗
Як цитувати цю сторінку
ScholarGate. (2026, June 3). Biological Pathway Enrichment Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/uk/bioinformatics/pathway-enrichment-analysis
Який метод?
Поставте цей метод поруч із його найближчими спорідненими й читайте їх пліч-о-пліч — бібліотека викладає книги на стіл; вибір за вами.
- Аналіз збагачення генних наборів (GSEA)Біоінформатика↔ порівняти
- Аналіз метаболомікиБіоінформатика↔ порівняти
- Мережевий аналіз збагачення шляхівБіоінформатика↔ порівняти
- Протеомічний аналізБіоінформатика↔ порівняти
- Аналіз диференційної експресії генів методом RNA-seqБіоінформатика↔ порівняти
- Аналіз одноклітинної РНК-секвенціїБіоінформатика↔ порівняти
Згадується в
Помітили помилку на цій сторінці? Повідомте про неї або запропонуйте виправлення →