Аналіз одноклітинної РНК-секвенції часових рядів — Темпоральна транскриптоміка з одноклітинною роздільною здатністю
Аналіз одноклітинної РНК-секвенції часових рядів фіксує експресію генів у кількох часових точках з одноклітинною роздільною здатністю, щоб виявити, як популяції клітин виникають, трансформуються та розходяться під час динамічних біологічних процесів, таких як розвиток, диференціація або прогресування захворювання. Комбінуючи псевдочасове впорядкування, РНК-швидкість та тестування диференціальної динаміки, дослідники реконструюють часову траєкторію окремих клітин та ідентифікують зміни в регуляції генів, що керують біологічними переходами.
Читати метод повністю
Увійдіть із безкоштовним обліковим записом, щоб прочитати цей розділ.
Карта методів
Околиця споріднених методів — виберіть вузол, щоб дослідити.
Джерела
- Trapnell, C., Cacchiarelli, D., Grimsby, J., Pokharel, P., Li, S., Morse, M., Lennon, N. J., Livak, K. J., Mikkelsen, T. S., & Rinn, J. L. (2014). The dynamics and regulators of cell fate decisions are revealed by pseudotemporal ordering of single cells. Nature Biotechnology, 32(4), 381-386. DOI: 10.1038/nbt.2859 ↗
- La Manno, G., Soldatov, R., Zeisel, A., Braun, E., Hochgerner, H., Petukhov, V., Lidschreiber, K., Kastriti, M. E., Lonnerberg, P., Furlan, A., Fan, J., Borm, L. E., Liu, Z., van Bruggen, D., Guo, J., He, X., Linnarsson, S., & Kharchenko, P. V. (2018). RNA velocity of single cells. Nature, 560(7719), 494-498. DOI: 10.1038/s41586-018-0414-6 ↗
Як цитувати цю сторінку
ScholarGate. (2026, June 3). Time-Series Single-Cell RNA Sequencing Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/uk/bioinformatics/time-series-single-cell-rna-seq-analysis
Який метод?
Поставте цей метод поруч із його найближчими спорідненими й читайте їх пліч-о-пліч — бібліотека викладає книги на стіл; вибір за вами.
- Аналіз варіацій кількості копійБіоінформатика↔ порівняти
- Аналіз eQTLБіоінформатика↔ порівняти
- Аналіз збагачення генних наборів (GSEA)Біоінформатика↔ порівняти
- Аналіз збагачення шляхівБіоінформатика↔ порівняти
- Аналіз диференційної експресії генів методом RNA-seqБіоінформатика↔ порівняти
- Аналіз одноклітинної РНК-секвенціїБіоінформатика↔ порівняти
Згадується в
Similar methods
Помітили помилку на цій сторінці? Повідомте про неї або запропонуйте виправлення →