Single-cell GWAS — Аналіз генетичної асоціації на рівні окремих клітин
Single-cell GWAS — це інтегративний біоінформатичний конвеєр, який відображає сигнали дослідження генетичної асоціації в масштабі геному (GWAS) на транскриптомні ландшафти окремих клітин, щоб визначити, які типи клітин та окремі клітини несуть непропорційний генетичний ризик для захворювання чи ознаки. Використовуючи атласи транскриптоміки окремих клітин поряд із статистикою GWAS, він виходить за межі асоціацій на рівні тканин, щоб виявити точні клітинні контексти, в яких генетичні варіанти, пов'язані з хворобою, проявляють свої ефекти.
Читати метод повністю
Увійдіть із безкоштовним обліковим записом, щоб прочитати цей розділ.
Method map
The neighbourhood of related methods — select a node to explore.
Джерела
- Zhang, M. J., Hou, K., Dey, K. K., Sakaue, S., Jagadeesh, K. A., Weinand, K., ... & Price, A. L. (2022). Polygenic enrichment distinguishes disease associations of individual cells in single-cell RNA-seq data. Nature Genetics, 54(8), 1224-1234. link ↗
- Bryois, J., Calini, D., Macnair, W., Foo, L., Urich, E., Ortmann, W., ... & De Jager, P. L. (2022). Cell-type-specific cis-eQTLs in eight human brain cell types identify novel risk genes for psychiatric and neurological disorders. Nature Neuroscience, 25(8), 1104-1112. link ↗
Як цитувати цю сторінку
ScholarGate. (2026, June 3). Single-Cell Genome-Wide Association Study. ScholarGate. https://scholargate.app/uk/bioinformatics/single-cell-gwas
Which method?
Set this method beside its closest kin and read them side by side — the library lays the books on the table; the choice is yours.
- Аналіз eQTLБіоінформатика↔ compare
- Повногеномне асоціативне дослідження (GWAS)Біоінформатика↔ compare
- Аналіз збагачення шляхівБіоінформатика↔ compare
- Аналіз диференційної експресії генів методом RNA-seqБіоінформатика↔ compare
- Аналіз eQTL на рівні окремих клітинБіоінформатика↔ compare
- Аналіз одноклітинної РНК-секвенціїБіоінформатика↔ compare
Згадується в
Помітили помилку на цій сторінці? Повідомте про неї або запропонуйте виправлення →