Мережевий аналіз збагачення шляхів
Мережевий аналіз збагачення шляхів інтегрує мережі молекулярних взаємодій — білок-білкові взаємодії, сигнальні графіки або ген-регуляторні мережі — з оміксними вимірюваннями для виявлення біологічних шляхів, які скоординовано змінені за певних умов. На відміну від класичних підходів надмірного представлення або збагачення генних наборів, які розглядають гени шляху як незалежні списки, цей клас методів поширює сигнали через ребра мережі, враховуючи топологію взаємодій та виявляючи дезрігульовані модулі, які були б пропущені при збагаченні плоских списків.
Читати метод повністю
Увійдіть із безкоштовним обліковим записом, щоб прочитати цей розділ.
Карта методів
Околиця споріднених методів — виберіть вузол, щоб дослідити.
Джерела
- Ideker, T., Ozier, O., Schwikowski, B., & Siegel, A. F. (2002). Discovering regulatory and signalling circuits in molecular interaction networks. Bioinformatics, 18(suppl_1), S233–S240. link ↗
- Vaske, C. J., Benz, S. C., Sanborn, J. Z., Earl, D., Szeto, C., Zhu, J., Haussler, D., & Stuart, J. M. (2010). Inference of patient-specific pathway activities from multi-dimensional cancer genomics data using PARADIGM. Bioinformatics, 26(12), i237–i245. DOI: 10.1093/bioinformatics/btq182 ↗
Як цитувати цю сторінку
ScholarGate. (2026, June 3). Network-based Pathway Enrichment Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/uk/bioinformatics/network-based-pathway-enrichment-analysis
Який метод?
Поставте цей метод поруч із його найближчими спорідненими й читайте їх пліч-о-пліч — бібліотека викладає книги на стіл; вибір за вами.
- Аналіз збагачення генних наборів (GSEA)Біоінформатика↔ порівняти
Згадується в
Помітили помилку на цій сторінці? Повідомте про неї або запропонуйте виправлення →