Мережевий аналіз варіацій числа копій
Мережевий аналіз варіацій числа копій (ВЧК) інтегрує геномні дані ВЧК з біологічними мережами взаємодій — такими як мережі білок-білкових взаємодій (ББВ) або мережі шляхів — для виявлення функціонально когерентних регіонів, генів-драйверів та змінених підмереж, які неможливо знайти за допомогою одного лише виклику ВЧК. Шляхом поширення сигналів ВЧК через граф мережі метод виявляє скоординовані геномні дисбаланси дозування, що збігаються зі спільними біологічними функціями, що робить його особливо потужним у геноміці раку та дослідженнях рідкісних захворювань.
Читати метод повністю
Увійдіть із безкоштовним обліковим записом, щоб прочитати цей розділ.
Method map
The neighbourhood of related methods — select a node to explore.
Джерела
- Vandin, F., Upfal, E., & Raphael, B. J. (2012). De novo discovery of mutated driver pathways in cancer. Genome Research, 22(2), 375–385. DOI: 10.1101/gr.120477.111 ↗
- Leiserson, M. D. M., Vandin, F., Wu, H.-T., Dobson, J. R., Eldridge, J. V., Thomas, J. L., Papoutsaki, A., Kim, Y., Niu, B., McLellan, M., Lawrence, M. S., Gonzalez-Perez, A., Tamborero, D., Cheng, Y., Ryslik, G. A., Lopez-Bigas, N., Getz, G., Ding, L., & Raphael, B. J. (2015). Pan-cancer network analysis identifies combinations of rare somatic mutations across pathways and protein complexes. Nature Genetics, 47(2), 106–114. DOI: 10.1038/ng.3168 ↗
Як цитувати цю сторінку
ScholarGate. (2026, June 3). Network-Based Copy Number Variation Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/uk/bioinformatics/network-based-copy-number-variation-analysis
Which method?
Set this method beside its closest kin and read them side by side — the library lays the books on the table; the choice is yours.
- Аналіз варіацій кількості копійБіоінформатика↔ compare
- Аналіз збагачення генних наборів (GSEA)Біоінформатика↔ compare
- Мережевий підхід до GWASБіоінформатика↔ compare
- Мережевий аналіз диференційної експресії RNA-seqБіоінформатика↔ compare
- Аналіз збагачення шляхівБіоінформатика↔ compare
- Виявлення варіантівБіоінформатика↔ compare
Помітили помилку на цій сторінці? Повідомте про неї або запропонуйте виправлення →