Аналіз різноманітності мікробіому в часових рядах — Поздовжній аналіз різноманітності мікробіому
Поздовжній аналіз різноманітності мікробіому відстежує, як багатство, рівномірність та склад мікробних спільнот змінюються протягом багатьох часових точок у межах одних і тих самих суб'єктів. Поєднуючи стандартні показники різноманітності з поздовжніми статистичними моделями, він відокремлює справжню часову динаміку від міжіндивідуальних варіацій, визначаючи, коли і як збурення, такі як зміни дієти, антибіотикотерапія або початок захворювання, змінюють мікробіом.
Читати метод повністю
Увійдіть із безкоштовним обліковим записом, щоб прочитати цей розділ.
Карта методів
Околиця споріднених методів — виберіть вузол, щоб дослідити.
Джерела
- Callahan, B. J., McMurdie, P. J., Rosen, M. J., Han, A. W., Johnson, A. J. A., & Holmes, S. P. (2016). DADA2: High-resolution sample inference from Illumina amplicon data. Nature Methods, 13(7), 581–583. DOI: 10.1038/nmeth.3869 ↗
- Chen, Y., Lun, A. T. L., & Smyth, G. K. (2023). Differential abundance testing on single-cell data using quasi-likelihood methods. Genome Biology, 24(1), 188. link ↗
Як цитувати цю сторінку
ScholarGate. (2026, June 3). Longitudinal Microbiome Diversity Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/uk/bioinformatics/time-series-microbiome-diversity-analysis
Який метод?
Поставте цей метод поруч із його найближчими спорідненими й читайте їх пліч-о-пліч — бібліотека викладає книги на стіл; вибір за вами.
- Мультиомний аналіз різноманітності мікробіомуБіоінформатика↔ порівняти
- Аналіз збагачення шляхівБіоінформатика↔ порівняти
- Аналіз диференційної експресії генів методом RNA-seqБіоінформатика↔ порівняти
- Аналіз одноклітинної РНК-секвенціїБіоінформатика↔ порівняти
- Диференційна експресія генів у часових рядах РНК-секБіоінформатика↔ порівняти
Similar methods
Помітили помилку на цій сторінці? Повідомте про неї або запропонуйте виправлення →