Збагачений аналіз наборів генів для одноклітинних даних — scGSEA
Збагачений аналіз наборів генів для одноклітинних даних (scGSEA) розширює класичний масовий GSEA до роздільної здатності окремих клітин. Замість того, щоб перевіряти, чи збагачений набір генів у порівнянні на рівні зразка, scGSEA призначає показник збагачення або активності кожній клітині, дозволяючи дослідникам відображати активність шляхів у гетерогенних клітинних популяціях, станах клітин та траєкторіях розвитку, зафіксованих у даних одноклітинного секвенування РНК.
Читати метод повністю
Увійдіть із безкоштовним обліковим записом, щоб прочитати цей розділ.
Карта методів
Околиця споріднених методів — виберіть вузол, щоб дослідити.
Джерела
- Aibar, S., Gonzalez-Blas, C. B., Moerman, T., Huynh-Thu, V. A., Imrichova, H., Hulselmans, G., Rambow, F., Marine, J.-C., Geurts, P., Aerts, J., van den Oord, J., Kalender Atak, Z., Wouters, J., & Aerts, S. (2017). SCENIC: Single-cell regulatory network inference and clustering. Nature Methods, 14(11), 1083-1086. link ↗
- DeTomaso, D., Jones, M. G., Subramaniam, M., Ashuach, T., Ye, C. J., & Yosef, N. (2019). Functional interpretation of single cell similarity maps. Nature Communications, 10(1), 4376. link ↗
Як цитувати цю сторінку
ScholarGate. (2026, June 3). Single-cell Gene Set Enrichment Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/uk/bioinformatics/single-cell-gene-set-enrichment-analysis
Який метод?
Поставте цей метод поруч із його найближчими спорідненими й читайте їх пліч-о-пліч — бібліотека викладає книги на стіл; вибір за вами.
- Аналіз збагачення генних наборів (GSEA)Біоінформатика↔ порівняти
- Аналіз збагачення шляхівБіоінформатика↔ порівняти
- Аналіз диференційної експресії генів методом RNA-seqБіоінформатика↔ порівняти
- Аналіз одноклітинної РНК-секвенціїБіоінформатика↔ порівняти
- Аналіз диференційної експресії генів у одноклітинній РНК-секвенуванніБіоінформатика↔ порівняти
Згадується в
Similar methods
Помітили помилку на цій сторінці? Повідомте про неї або запропонуйте виправлення →