Мережевий аналіз РНК-сек одного клітинного рівня
Мережевий аналіз РНК-сек одного клітинного рівня (scRNA-seq) розширює стандартні робочі процеси scRNA-seq шляхом побудови та дослідження мереж молекулярних взаємодій — мереж генної регуляції, мереж спільної експресії або графів комунікації між клітинами — з даних одноклітинної транскриптоміки. Замість того, щоб розглядати кожен ген незалежно, цей підхід фіксує скоординовану активність генних кіл та міжклітинних сигнальних шляхів у межах популяцій клітин та між ними, забезпечуючи системний погляд на транскрипційну регуляцію з роздільною здатністю на рівні окремих клітин.
Читати метод повністю
Увійдіть із безкоштовним обліковим записом, щоб прочитати цей розділ.
Method map
The neighbourhood of related methods — select a node to explore.
Джерела
- Aibar, S., González-Blas, C. B., Moerman, T., Huynh-Thu, V. A., Imrichova, H., Hulselmans, G., ... & Aerts, S. (2017). SCENIC: single-cell regulatory network inference and clustering. Nature Methods, 14(11), 1083–1086. link ↗
- Jin, S., Guerrero-Juarez, C. F., Zhang, L., Chang, I., Ramos, R., Kuan, C. H., ... & Nie, Q. (2021). Inference and analysis of cell-cell communication using CellChat. Nature Communications, 12(1), 1088. link ↗
Як цитувати цю сторінку
ScholarGate. (2026, June 3). Network-based Single-Cell RNA Sequencing Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/uk/bioinformatics/network-based-single-cell-rna-seq-analysis
Which method?
Set this method beside its closest kin and read them side by side — the library lays the books on the table; the choice is yours.
- Аналіз збагачення генних наборів (GSEA)Біоінформатика↔ compare
- Мережевий аналіз диференційної експресії RNA-seqБіоінформатика↔ compare
- Аналіз збагачення шляхівБіоінформатика↔ compare
- Аналіз диференційної експресії генів методом RNA-seqБіоінформатика↔ compare
- Аналіз eQTL на рівні окремих клітинБіоінформатика↔ compare
- Аналіз одноклітинної РНК-секвенціїБіоінформатика↔ compare
Помітили помилку на цій сторінці? Повідомте про неї або запропонуйте виправлення →