Аналіз одноклітинної РНК-секвенції — scRNA-seq
Аналіз одноклітинної РНК-секвенції (scRNA-seq) характеризує експресію генів на рівні окремих клітин, що дозволяє виявляти типи, стани та переходи клітин, які є невидимими при масовій транскриптоміці. Починаючи з необроблених даних секвенування, робочий процес створює матрицю підрахунку клітина-ген і проходить через контроль якості, нормалізацію, зменшення розмірності, некеровану кластеризацію, анотацію типів клітин та низку подальших аналізів, таких як виведення траєкторій та диференціальна експресія між популяціями клітин.
Читати метод повністю
Увійдіть із безкоштовним обліковим записом, щоб прочитати цей розділ.
Карта методів
Околиця споріднених методів — виберіть вузол, щоб дослідити.
+ще 19
Джерела
- Satija, R., Farrell, J. A., Gennert, D., Schier, A. F., & Regev, A. (2015). Spatial reconstruction of single-cell gene expression data. Nature Biotechnology, 33(5), 495–502. DOI: 10.1038/nbt.3192 ↗
- Macosko, E. Z., Basu, A., Satija, R., Nemesh, J., Shekhar, K., Goldman, M., ... & McCarroll, S. A. (2015). Highly parallel genome-wide expression profiling of individual cells using nanoliter droplets. Cell, 161(5), 1202–1214. DOI: 10.1016/j.cell.2015.05.002 ↗
Як цитувати цю сторінку
ScholarGate. (2026, June 3). Single-cell RNA Sequencing Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/uk/bioinformatics/single-cell-rna-seq-analysis
Який метод?
Поставте цей метод поруч із його найближчими спорідненими й читайте їх пліч-о-пліч — бібліотека викладає книги на стіл; вибір за вами.
- Аналіз збагачення генних наборів (GSEA)Біоінформатика↔ порівняти
- Аналіз збагачення шляхівБіоінформатика↔ порівняти
- Аналіз диференційної експресії генів методом RNA-seqБіоінформатика↔ порівняти
- Аналіз eQTL на рівні окремих клітинБіоінформатика↔ порівняти
- Виявлення варіантів на рівні однієї клітиниБіоінформатика↔ порівняти
Згадується в
Помітили помилку на цій сторінці? Повідомте про неї або запропонуйте виправлення →