Мультиоміксний одноклітинний аналіз РНК-секвенування — Інтегративне мультимодальне одноклітинне профілювання
Мультиоміксний одноклітинний аналіз РНК-секвенування інтегрує два або більше молекулярних шарів — таких як експресія генів (scRNA-seq), доступність хроматину (scATAC-seq) або кількість поверхневих білків (CITE-seq) — виміряних одночасно або спільно профільованих в одних і тих самих клітинах. Зіставляючи ці модальності у спільному низьковимірному просторі, дослідники отримують більш глибоке механістичне уявлення про ідентичність клітин, регуляторний стан та фенотип, ніж може надати будь-який окремий аналіз.
Читати метод повністю
Увійдіть із безкоштовним обліковим записом, щоб прочитати цей розділ.
Карта методів
Околиця споріднених методів — виберіть вузол, щоб дослідити.
Джерела
- Hao, Y., Hao, S., Andersen-Nissen, E., Mauck, W. M., Zheng, S., Butler, A., Lee, M. J., Wilk, A. J., Darby, C., Zager, M., Hoffman, P., Stoeckius, M., Papalexi, E., Mimitou, E. P., Jain, J., Srivastava, A., Stuart, T., Fleming, L. M., Yeung, B., Rogers, A. J., McElrath, J. M., Blish, C. A., Gottardo, R., Smibert, P., & Satija, R. (2021). Integrated analysis of multimodal single-cell data. Cell, 184(13), 3573–3587.e29. link ↗
- Argelaguet, R., Arnol, D., Bredikhin, D., Deloro, Y., Velten, B., Marioni, J. C., & Stegle, O. (2020). MOFA+: a statistical framework for comprehensive integration of multi-modal single-cell data. Genome Biology, 21(1), 111. link ↗
Як цитувати цю сторінку
ScholarGate. (2026, June 3). Multi-omics Single-Cell RNA Sequencing Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/uk/bioinformatics/multi-omics-single-cell-rna-seq-analysis
Який метод?
Поставте цей метод поруч із його найближчими спорідненими й читайте їх пліч-о-пліч — бібліотека викладає книги на стіл; вибір за вами.
- Пікове викликування ChIP-seqБіоінформатика↔ порівняти
- Аналіз збагачення генних наборів (GSEA)Біоінформатика↔ порівняти
- Мультиомний аналіз диференціальної експресії РНК-секвенуванняБіоінформатика↔ порівняти
- Аналіз збагачення шляхівБіоінформатика↔ порівняти
- Аналіз диференційної експресії генів методом RNA-seqБіоінформатика↔ порівняти
- Аналіз одноклітинної РНК-секвенціїБіоінформатика↔ порівняти
Помітили помилку на цій сторінці? Повідомте про неї або запропонуйте виправлення →