Аналіз збагачення наборів генів у часових рядах — динамічне збагачення шляхів у різні моменти часу
Аналіз збагачення наборів генів у часових рядах (TS-GSEA) розширює класичну структуру GSEA для виявлення біологічно скоординованих наборів генів — шляхів, термінів генної онтології або курованих сигнатур, — чия колективна експресія значуще змінюється з часом. Замість порівняння двох знімків, він моделює повну часову траєкторію експресії генів, щоб ідентифікувати, які функціональні програми активуються, пригнічуються або динамічно перебудовуються під час біологічного процесу, такого як розвиток, відповідь на лікування або прогресування захворювання.
Читати метод повністю
Увійдіть із безкоштовним обліковим записом, щоб прочитати цей розділ.
Карта методів
Околиця споріднених методів — виберіть вузол, щоб дослідити.
Джерела
- Subramanian, A., Tamayo, P., Mootha, V. K., Mukherjee, S., Ebert, B. L., Gillette, M. A., Paulovich, A., Pomeroy, S. L., Golub, T. R., Lander, E. S., & Mesirov, J. P. (2005). Gene set enrichment analysis: A knowledge-based approach for interpreting genome-wide expression profiles. Proceedings of the National Academy of Sciences, 102(43), 15545–15550. DOI: 10.1073/pnas.0506580102 ↗
- Nueda, M. J., Tarazona, S., & Conesa, A. (2014). Next maSigPro: updating maSigPro bioconductor package for RNA-seq time series. Bioinformatics, 30(18), 2598–2602. DOI: 10.1093/bioinformatics/btu333 ↗
Як цитувати цю сторінку
ScholarGate. (2026, June 3). Time-Series Gene Set Enrichment Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/uk/bioinformatics/time-series-gene-set-enrichment-analysis
Який метод?
Поставте цей метод поруч із його найближчими спорідненими й читайте їх пліч-о-пліч — бібліотека викладає книги на стіл; вибір за вами.
- Аналіз збагачення генних наборів (GSEA)Біоінформатика↔ порівняти
- Багатованісна збагаченість генних наборівБіоінформатика↔ порівняти
- Аналіз збагачення шляхівБіоінформатика↔ порівняти
- Аналіз диференційної експресії генів методом RNA-seqБіоінформатика↔ порівняти
- Аналіз одноклітинної РНК-секвенціїБіоінформатика↔ порівняти
- Диференційна експресія генів у часових рядах РНК-секБіоінформатика↔ порівняти
Similar methods
Помітили помилку на цій сторінці? Повідомте про неї або запропонуйте виправлення →