Мережевий аналіз збагачення генних наборів
Мережевий аналіз збагачення генних наборів (network GSEA) розширює класичний GSEA шляхом включення біологічних мереж взаємодій — таких як мережі білок-білкова взаємодія (PPI) або коекспресійні графі — у тест на збагачення. Замість того, щоб розглядати кожен ген незалежно, метод поширює сигнали диференційної експресії через ребра мережі, дозволяючи генам, які спільно регулюються або функціонально пов'язані, спільно підтримувати значущість генного набору. Результатом є біологічно узгоджена оцінка збагачення, яка враховує топологію шляху та залежності між генами.
Читати метод повністю
Увійдіть із безкоштовним обліковим записом, щоб прочитати цей розділ.
Карта методів
Околиця споріднених методів — виберіть вузол, щоб дослідити.
Джерела
- Shojaie, A., & Michailidis, G. (2010). Network enrichment analysis in complex experiments. Statistical Applications in Genetics and Molecular Biology, 9(1), Article 22. link ↗
- Subramanian, A., Tamayo, P., Mootha, V. K., Mukherjee, S., Ebert, B. L., Gillette, M. A., Paulovich, A., Pomeroy, S. L., Golub, T. R., Lander, E. S., & Mesirov, J. P. (2005). Gene set enrichment analysis: A knowledge-based approach for interpreting genome-wide expression profiles. Proceedings of the National Academy of Sciences, 102(43), 15545-15550. link ↗
Як цитувати цю сторінку
ScholarGate. (2026, June 3). Network-Based Gene Set Enrichment Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/uk/bioinformatics/network-based-gene-set-enrichment-analysis
Який метод?
Поставте цей метод поруч із його найближчими спорідненими й читайте їх пліч-о-пліч — бібліотека викладає книги на стіл; вибір за вами.
- Аналіз збагачення генних наборів (GSEA)Біоінформатика↔ порівняти
- Мережевий підхід до GWASБіоінформатика↔ порівняти
- Аналіз збагачення шляхівБіоінформатика↔ порівняти
- Аналіз диференційної експресії генів методом RNA-seqБіоінформатика↔ порівняти
- Збагачений аналіз наборів генів для одноклітинних данихБіоінформатика↔ порівняти
Згадується в
Similar methods
Помітили помилку на цій сторінці? Повідомте про неї або запропонуйте виправлення →