Аналіз варіацій числа копій на рівні окремих клітин
Аналіз варіацій числа копій на рівні окремих клітин (scCNV) виявляє ампліфікації та делеції геномних сегментів у межах окремих клітин, що дозволяє дослідникам розрізняти внутрішньопухлинну гетерогенність, реконструювати клональну еволюцію та відрізняти злоякісні клітини від нормальних з роздільною здатністю на рівні окремої клітини. Його можна застосовувати безпосередньо до даних повногеномного секвенування окремих клітин або виводити з сигналів глибини прочитань в експериментах scRNA-seq або scATAC-seq.
Читати метод повністю
Увійдіть із безкоштовним обліковим записом, щоб прочитати цей розділ.
Карта методів
Околиця споріднених методів — виберіть вузол, щоб дослідити.
Джерела
- Garvin, T., Aboukhalil, R., Kendall, J., Baslan, T., Atwal, G. S., Hicks, J., Wigler, M., & Schatz, M. C. (2015). Interactive analysis and assessment of single-cell copy-number variations. Nature Methods, 12(11), 1058–1060. link ↗
- Gao, R., Bai, S., Henderson, Y. C., Lin, Y., Schalck, A., Yan, Y., Kumar, T., Hu, M., Sei, E., Davis, A., Wang, F., Shaitelman, S. F., Wang, J. R., Chen, K., Moulder, S., Lai, S. Y., & Navin, N. E. (2021). Delineating copy number and clonal substructure in human tumors from single-cell transcriptomes. Nature Biotechnology, 39(5), 599–608. link ↗
Як цитувати цю сторінку
ScholarGate. (2026, June 3). Single-cell Copy Number Variation Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/uk/bioinformatics/single-cell-copy-number-variation-analysis
Який метод?
Поставте цей метод поруч із його найближчими спорідненими й читайте їх пліч-о-пліч — бібліотека викладає книги на стіл; вибір за вами.
- Аналіз варіацій кількості копійБіоінформатика↔ порівняти
- Однокліткове епігеном-широке асоціативне дослідження (scEWAS)Біоінформатика↔ порівняти
- Single-cell GWASБіоінформатика↔ порівняти
- Аналіз одноклітинної РНК-секвенціїБіоінформатика↔ порівняти
- Аналіз диференційної експресії генів у одноклітинній РНК-секвенуванніБіоінформатика↔ порівняти
- Виявлення варіантівБіоінформатика↔ порівняти
Згадується в
Помітили помилку на цій сторінці? Повідомте про неї або запропонуйте виправлення →