Визначення піків ChIP-seq на рівні окремих клітин — Епігеномне профілювання scChIP-seq
Визначення піків ChIP-seq на рівні окремих клітин — це біоінформатичний конвеєр, який ідентифікує геномні регіони, збагачені модифікаціями гістонів або зв'язуванням факторів транскрипції в окремих клітинах. Профілюючи стани хроматину з роздільною здатністю окремих клітин, він виявляє епігеномну гетерогенність, приховану в експериментах ChIP-seq на масиві клітин, дозволяючи дослідникам картографувати регуляторні ландшафти різних популяцій клітин у складному зразку тканини.
Читати метод повністю
Увійдіть із безкоштовним обліковим записом, щоб прочитати цей розділ.
Method map
The neighbourhood of related methods — select a node to explore.
Джерела
- Grosselin, K., Durand, A., Marsolier, J., Poitou, A., Marangoni, E., Nemati, F., ... & Vallot, C. (2019). High-throughput single-cell ChIP-seq identifies heterogeneity of chromatin states in breast cancer. Nature Genetics, 51(6), 1060-1066. link ↗
- Ku, W. L., Nakamura, K., Gao, W., Cui, K., Hu, G., Tang, Q., ... & Zhao, K. (2019). Single-cell chromatin immunocleavage sequencing (scChIC-seq) to profile histone modification. Nature Methods, 16(4), 323-325. link ↗
Як цитувати цю сторінку
ScholarGate. (2026, June 3). Single-cell Chromatin Immunoprecipitation Sequencing Peak Calling. ScholarGate. https://scholargate.app/uk/bioinformatics/single-cell-chip-seq-peak-calling
Which method?
Set this method beside its closest kin and read them side by side — the library lays the books on the table; the choice is yours.
- Пікове викликування ChIP-seqБіоінформатика↔ compare
- Епігеномне повногеномне дослідження асоціацій (EWAS)Біоінформатика↔ compare
- Однокліткове епігеном-широке асоціативне дослідження (scEWAS)Біоінформатика↔ compare
- Аналіз одноклітинної РНК-секвенціїБіоінформатика↔ compare
- Вирівнювання одноклітинних послідовностейБіоінформатика↔ compare
Помітили помилку на цій сторінці? Повідомте про неї або запропонуйте виправлення →