Виявлення варіантів на рівні однієї клітини — виявлення мутацій з клітинною роздільною здатністю
Виявлення варіантів на рівні однієї клітини (single-cell variant calling) — це біоінформатичний конвеєр, який ідентифікує варіанти послідовності ДНК — однонуклеотидні варіанти (SNV), малі інсерції та делеції, а також зміни кількості копій — в окремих клітинах, а не в суміші тканин. Вирішуючи мутаційний ландшафт клітина за клітиною, він виявляє внутрішньопухлинну гетерогенність, клональну архітектуру та соматичні мутаційні патерни, які приховуються масовим секвенуванням. Цей підхід є центральним у геноміці раку, біології розвитку та будь-яких дослідженнях, де генетична різноманітність між клітинами є основним питанням.
Читати метод повністю
Увійдіть із безкоштовним обліковим записом, щоб прочитати цей розділ.
Method map
The neighbourhood of related methods — select a node to explore.
Джерела
- Zafar, H., Wang, Y., Nakhleh, L., Navin, N., & Chen, K. (2016). Monovar: single-nucleotide variant detection in single cells. Nature Methods, 13(6), 505–507. DOI: 10.1038/nmeth.3835 ↗
- Singer, J., Ruscheweyh, H. J., Doherr, M. G., Stadler, T., & Althaus, C. L. (2021). Single-nucleotide variant calling in single-cell sequencing data with piccolo. BMC Bioinformatics, 22(1), 333. link ↗
Як цитувати цю сторінку
ScholarGate. (2026, June 3). Single-Cell Genomic Variant Calling. ScholarGate. https://scholargate.app/uk/bioinformatics/single-cell-variant-calling
Which method?
Set this method beside its closest kin and read them side by side — the library lays the books on the table; the choice is yours.
- Аналіз варіацій кількості копійБіоінформатика↔ compare
Згадується в
Помітили помилку на цій сторінці? Повідомте про неї або запропонуйте виправлення →