Mrežna analiza obogaćenosti genskih skupova
Mrežna analiza obogaćenosti genskih skupova (mrežna GSEA) proširuje klasičnu GSEA uključivanjem bioloških mreža interakcija — kao što su mreže interakcija protein-protein (PPI) ili koekspresije — u test obogaćenosti. Umesto da se svaki gen tretira nezavisno, metoda propagira signale diferencijalne ekspresije preko mrežnih veza, omogućavajući genima koji su ko-regulirani ili funkcionalno povezani da zajednički podrže značaj genskog skupa. Rezultat je biološki koherentan rezultat obogaćenosti koji uzima u obzir topologiju puta i zavisnosti gen-gen.
Pročitajte celu metodu
Prijavite se besplatnim nalogom da biste pročitali ovaj odeljak.
Mapa metoda
Okruženje srodnih metoda — izaberite čvor da biste istraživali.
Izvori
- Shojaie, A., & Michailidis, G. (2010). Network enrichment analysis in complex experiments. Statistical Applications in Genetics and Molecular Biology, 9(1), Article 22. link ↗
- Subramanian, A., Tamayo, P., Mootha, V. K., Mukherjee, S., Ebert, B. L., Gillette, M. A., Paulovich, A., Pomeroy, S. L., Golub, T. R., Lander, E. S., & Mesirov, J. P. (2005). Gene set enrichment analysis: A knowledge-based approach for interpreting genome-wide expression profiles. Proceedings of the National Academy of Sciences, 102(43), 15545-15550. link ↗
Kako citirati ovu stranicu
ScholarGate. (2026, June 3). Network-Based Gene Set Enrichment Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/sr/bioinformatics/network-based-gene-set-enrichment-analysis
Koja metoda?
Postavite ovu metodu pored njoj najbližih srodnika i čitajte ih uporedo — biblioteka polaže knjige na sto; izbor je na vama.
- Analiza obogaćenja genskih skupova (GSEA)Bioinformatika↔ uporedi
- Mrežna studija genskih asocijacijaBioinformatika↔ uporedi
- Analiza obogaćenosti putaBioinformatika↔ uporedi
- RNA-seq Differential ExpressionBioinformatika↔ uporedi
- Jednoćelijska analiza obogaćenosti genskih skupovaBioinformatika↔ uporedi
Citirana u
Uočili ste grešku na ovoj stranici? Prijavite je ili predložite ispravku →