Bayesian ChIP-seq Peak Calling — Probabilisticno otkrivanje obogaćenja u epigenomskim podacima

Bayesian ChIP-seq peak calling primenjuje probabilističke modele — tipično Poasonove, negativne binomne ili skrivene Markovljeve modele sa Bejzijanskom inferencijom — za detekciju genomičkih regiona obogaćenih za protein od interesa u eksperimentima hromatin imunoprecipitacije praćenim sekvenciranjem. Eksplicitnim modelovanjem šuma u broju očitavanja i uključivanjem apriornih distribucija, Bejzijanski pozivaoci daju aposteriorne verovatnoće obogaćenja umesto jednostavnih p-vrednosti, pružajući principijelan okvir za kvantifikaciju nesigurnosti širom genoma.